299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0538 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  100 
 
 
173 aa  349  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  53.49 
 
 
195 aa  198  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  52.6 
 
 
176 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  53.49 
 
 
176 aa  192  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  51.76 
 
 
172 aa  186  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  51.16 
 
 
172 aa  185  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  52.91 
 
 
182 aa  185  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  52.47 
 
 
170 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  52.87 
 
 
170 aa  174  7e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  48.26 
 
 
176 aa  170  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  49.42 
 
 
175 aa  155  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  46.71 
 
 
173 aa  147  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  46.71 
 
 
184 aa  122  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  38.85 
 
 
169 aa  103  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  36.71 
 
 
172 aa  101  7e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  36 
 
 
170 aa  97.8  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  37.09 
 
 
165 aa  97.4  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  37.01 
 
 
171 aa  95.1  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  35.4 
 
 
169 aa  90.9  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  34 
 
 
169 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  32.89 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  36.65 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  30.92 
 
 
176 aa  84.7  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  37.66 
 
 
169 aa  84.7  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  30.77 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  33.33 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  30.67 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  30.67 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  30.13 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  29.94 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  31.07 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  30.61 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  27.81 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  32 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  30.87 
 
 
173 aa  80.1  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  33.55 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  29.49 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.5 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  29.49 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  27.78 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.73 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  30.26 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  29.11 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  30.25 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  25.85 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  30 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.23 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  29.3 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  29.38 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  30.97 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  36.54 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  29.94 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  29.22 
 
 
278 aa  72  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  29.41 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  28.07 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  31.33 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.57 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  29.19 
 
 
274 aa  67.8  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  25.57 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.19 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  30.87 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  29.28 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  27.81 
 
 
169 aa  66.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  29.87 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  28.57 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  27.59 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  25.9 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.62 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  28.66 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  28.16 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  27.81 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  30.92 
 
 
180 aa  63.9  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  29.22 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  29.7 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  26.59 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  26.59 
 
 
177 aa  63.5  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  25.95 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.59 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  28.39 
 
 
175 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  29.85 
 
 
188 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  26.78 
 
 
186 aa  62.4  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  30.82 
 
 
169 aa  61.6  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  30.32 
 
 
175 aa  61.6  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.75 
 
 
191 aa  61.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  30.13 
 
 
167 aa  61.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  31.98 
 
 
183 aa  60.8  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  27.75 
 
 
214 aa  60.8  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  24.71 
 
 
186 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  25.29 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28.07 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  29.01 
 
 
192 aa  59.7  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  26.47 
 
 
166 aa  58.9  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  27.2 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  33.09 
 
 
185 aa  58.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  28.26 
 
 
189 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  26.58 
 
 
191 aa  57.4  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  24.14 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  26.85 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  26.95 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  27.74 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>