More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1625 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  100 
 
 		 176 aa  362  2e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  50.87 
 
 		 176 aa  190  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  51.16 
 
 		 176 aa  187  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  51.16 
 
 		 195 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  47.67 
 
 		 182 aa  175  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  48.55 
 
 		 175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  48.26 
 
 		 173 aa  170  7.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  46.51 
 
 		 172 aa  170  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  44.77 
 
 		 172 aa  168  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  48.5 
 
 		 170 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  38.73 
 
 		 173 aa  154  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  48.57 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  42.95 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  34.3 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  37.01 
 
 		 163 aa  105  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  31.98 
 
 		 169 aa  103  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  29.31 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  29.31 
 
 		 166 aa  99.4  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  32.94 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  34.67 
 
 		 170 aa  95.9  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  33.14 
 
 		 171 aa  95.5  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  33.96 
 
 		 178 aa  95.1  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  29.94 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  28.16 
 
 		 169 aa  92.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  33.55 
 
 		 170 aa  90.1  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  29.31 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.42 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  31.46 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  27.43 
 
 		 169 aa  85.5  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  29.31 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  27.68 
 
 		 173 aa  84.7  6e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  30.82 
 
 		 178 aa  84.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  29.05 
 
 		 169 aa  84.3  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  30.89 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  27.33 
 
 		 171 aa  84.3  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  26.55 
 
 		 173 aa  84  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  27.84 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  27.84 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  33.71 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.45 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  28.74 
 
 		 169 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  30.52 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  29.89 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  31.45 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  31.03 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  26.55 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  33.56 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  30.87 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  29.93 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  26.29 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  32.21 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  35.22 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  29.21 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  27.12 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  29.19 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  28.82 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  27.89 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  29.56 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  29.07 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.61 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.17 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18320  nitroreductase  31.71 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  28.93 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  31.21 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  28.03 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  25.42 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  31.33 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  27.89 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  28.77 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  33.06 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.57 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  26.85 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  25.93 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  26.53 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  28.82 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0676  nitroreductase  29.12 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  26.74 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  30.85 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  26.25 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  28.46 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  32.28 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  28.86 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2217  nitroreductase  30.43 
 
 		 192 aa  67.4  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  28.85 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  30.37 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  29.89 
 
 		 185 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  29.09 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  31.54 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  29.94 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  28.05 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  26.59 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  26.32 
 
 		 191 aa  64.3  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  26.32 
 
 		 214 aa  64.3  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  25.86 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  25.93 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2166  nitroreductase  26.6 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  28.3 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1895  nitroreductase  26.67 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  26.4 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>