More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1838 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  100 
 
 		 274 aa  563  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  70.44 
 
 		 274 aa  411  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  60.07 
 
 		 275 aa  355  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  45.26 
 
 		 274 aa  268  5e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  41.61 
 
 		 275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  42.86 
 
 		 273 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  39.05 
 
 		 262 aa  217  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  39.78 
 
 		 284 aa  208  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  40.22 
 
 		 263 aa  208  9e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  38.26 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  37.96 
 
 		 273 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  38.27 
 
 		 274 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  37.23 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  33.82 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  33.94 
 
 		 272 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  33.58 
 
 		 273 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  32.48 
 
 		 272 aa  178  8e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  35.84 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  33.7 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  32.73 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  33.33 
 
 		 278 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  35.77 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  30.86 
 
 		 275 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  31 
 
 		 277 aa  148  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  31 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  31.64 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  28.47 
 
 		 277 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  32.61 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  27.84 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  30.91 
 
 		 271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  26.5 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  26.74 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  28.46 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  26.32 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  25.18 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  24.65 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  26.74 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  28.1 
 
 		 295 aa  87  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  23.6 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  28.02 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  21.86 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  24.06 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  24.66 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  27.81 
 
 		 196 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  24.08 
 
 		 190 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  29.87 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  21.98 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.04 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  28.79 
 
 		 188 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  24.55 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  26.82 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  28.65 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  29.67 
 
 		 178 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  27.06 
 
 		 188 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  27.6 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  28.26 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  25.86 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  28.81 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  27.54 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.71 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.02 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  27.01 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  21.16 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  29.05 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  28.88 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.53 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  25.71 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  27.48 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  27.27 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  27.43 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  27.89 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  29.17 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.6 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  29.17 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  28.65 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.65 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  29 
 
 		 446 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.32 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  27.65 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  23.86 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  24.87 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  24.37 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  29.51 
 
 		 178 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  25.14 
 
 		 165 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  28.65 
 
 		 448 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  26.9 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  31.51 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  26.78 
 
 		 458 aa  55.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  25.57 
 
 		 222 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  23.53 
 
 		 186 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  23.29 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  26.26 
 
 		 180 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5314  nitroreductase  27.03 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4933  nitroreductase  27.03 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.850383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5021  nitroreductase  27.03 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  25.68 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16880  nitroreductase  36.05 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.337759  normal  0.0536837 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  26.79 
 
 		 174 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  26.29 
 
 		 175 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  24.71 
 
 		 170 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>