More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0548 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  100 
 
 
166 aa  342  2e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  98.8 
 
 
166 aa  337  5e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  54.76 
 
 
173 aa  199  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  54.22 
 
 
174 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  49.4 
 
 
173 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  52.41 
 
 
176 aa  192  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  50.6 
 
 
173 aa  190  7e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  49.4 
 
 
173 aa  187  7e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  50.31 
 
 
169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  55.21 
 
 
174 aa  178  2e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  49.4 
 
 
169 aa  175  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  46.99 
 
 
169 aa  174  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  47.24 
 
 
169 aa  168  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  49.4 
 
 
169 aa  167  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  41.07 
 
 
171 aa  165  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  45.34 
 
 
163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  44.58 
 
 
169 aa  162  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  44.58 
 
 
171 aa  160  6e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  44.58 
 
 
171 aa  160  6e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  45.18 
 
 
169 aa  160  6e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  46.99 
 
 
169 aa  153  9e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  49.09 
 
 
170 aa  151  4e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  47.27 
 
 
169 aa  151  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  37.95 
 
 
166 aa  151  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  44.24 
 
 
166 aa  142  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  35.71 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  39.02 
 
 
171 aa  138  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  36.53 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  38.69 
 
 
197 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  38.24 
 
 
187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  44.64 
 
 
170 aa  122  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  38.92 
 
 
274 aa  121  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  36.31 
 
 
169 aa  117  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  39.52 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  35.68 
 
 
186 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  38.18 
 
 
174 aa  107  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  36.02 
 
 
169 aa  106  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.85 
 
 
204 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  35.68 
 
 
186 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  38.6 
 
 
194 aa  104  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  39.18 
 
 
194 aa  104  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  33.92 
 
 
176 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  32.43 
 
 
184 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  34.05 
 
 
186 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  32.53 
 
 
176 aa  100  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  29.31 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  33.33 
 
 
172 aa  98.6  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  36.26 
 
 
178 aa  97.8  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  34.42 
 
 
176 aa  97.8  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  33.53 
 
 
173 aa  97.4  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  33.33 
 
 
175 aa  97.1  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  40.26 
 
 
174 aa  97.1  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  37.82 
 
 
167 aa  97.1  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  36.99 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  34.5 
 
 
202 aa  96.7  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  32.65 
 
 
171 aa  96.7  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  33.33 
 
 
170 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  33.96 
 
 
176 aa  95.5  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  32.18 
 
 
172 aa  95.5  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  35.37 
 
 
168 aa  95.5  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  31.93 
 
 
173 aa  95.1  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  37.74 
 
 
192 aa  94.7  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  36.05 
 
 
189 aa  94.7  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  36.42 
 
 
163 aa  94.4  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  28.65 
 
 
187 aa  93.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  37.84 
 
 
171 aa  93.6  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  31.74 
 
 
170 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  33.68 
 
 
189 aa  92.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  33.97 
 
 
178 aa  92  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  34.34 
 
 
188 aa  91.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  33.11 
 
 
180 aa  91.7  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  32.64 
 
 
189 aa  91.7  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  31.9 
 
 
168 aa  91.3  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  35.09 
 
 
174 aa  90.5  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  32.11 
 
 
196 aa  90.1  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  33.33 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  35.53 
 
 
167 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  29.41 
 
 
188 aa  89  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  32.37 
 
 
172 aa  85.9  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  30.46 
 
 
278 aa  86.3  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  33.55 
 
 
170 aa  85.5  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  28.57 
 
 
196 aa  85.1  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  28.74 
 
 
182 aa  85.1  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  32.98 
 
 
190 aa  84.7  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  33.16 
 
 
212 aa  84.3  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  32.74 
 
 
188 aa  84  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  37.37 
 
 
184 aa  84  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  32.67 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  32.74 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  29.45 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  30.69 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  32.94 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  31.68 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  29.94 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  35.21 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  29.41 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  28.65 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  29.34 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  28.98 
 
 
195 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  31.35 
 
 
201 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>