More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0809 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  100 
 
 
169 aa  350  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  76.92 
 
 
169 aa  283  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  61.54 
 
 
174 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  57.4 
 
 
174 aa  197  7e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  51.5 
 
 
176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  52.66 
 
 
169 aa  190  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  52.07 
 
 
169 aa  186  9e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  50.3 
 
 
171 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  50.3 
 
 
171 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  58.58 
 
 
169 aa  180  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  45.56 
 
 
169 aa  178  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  49.11 
 
 
169 aa  177  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  51.76 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  44.97 
 
 
169 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  46.99 
 
 
166 aa  169  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  46.99 
 
 
166 aa  168  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  48.43 
 
 
163 aa  157  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  39.88 
 
 
173 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  38.69 
 
 
173 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  41.46 
 
 
169 aa  148  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  43.2 
 
 
171 aa  147  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  39.64 
 
 
173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  41.76 
 
 
201 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  39.88 
 
 
173 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  42.86 
 
 
187 aa  143  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  38.32 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  40.74 
 
 
169 aa  130  7.999999999999999e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  37.65 
 
 
197 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  35.19 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  39.39 
 
 
167 aa  122  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  39.51 
 
 
166 aa  121  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  36.47 
 
 
274 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  34.5 
 
 
176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  37.85 
 
 
178 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  36.72 
 
 
194 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  35.43 
 
 
182 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  38.01 
 
 
172 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  35.59 
 
 
194 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  36.02 
 
 
167 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  36.84 
 
 
172 aa  100  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  40.12 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  34.36 
 
 
170 aa  99  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  36.94 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  35.98 
 
 
167 aa  96.3  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  35.85 
 
 
170 aa  95.5  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  33.13 
 
 
180 aa  94.7  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  30.36 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  32.56 
 
 
175 aa  92.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  34.5 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  33.73 
 
 
195 aa  91.3  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  33.14 
 
 
174 aa  91.3  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  31.03 
 
 
176 aa  90.9  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  35.71 
 
 
174 aa  90.9  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  32.74 
 
 
187 aa  90.5  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  28.32 
 
 
173 aa  90.1  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.89 
 
 
184 aa  89.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  30.23 
 
 
176 aa  89.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  31.54 
 
 
171 aa  89  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.34 
 
 
584 aa  88.6  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  32.28 
 
 
176 aa  88.6  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  34.18 
 
 
171 aa  88.2  5e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  32.5 
 
 
177 aa  87.8  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  33.71 
 
 
178 aa  87  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  32.12 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  31.52 
 
 
169 aa  86.7  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  30.98 
 
 
191 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  30.29 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  30.98 
 
 
214 aa  85.9  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  31.91 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  29.7 
 
 
168 aa  85.1  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  29.79 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  34.38 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  32.41 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0862  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00254558  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2051  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000565957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3169  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.57 
 
 
219 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00240689  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.33 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  29.07 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  32.39 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  35.95 
 
 
172 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  35.12 
 
 
185 aa  80.9  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3222  nitroreductase family protein  29.06 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00153701  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  26.29 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2694  nitroreductase family protein  29.06 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.990195  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3208  nitroreductase family protein  29.06 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.89 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  30.36 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1401  nitroreductase family protein  28.08 
 
 
368 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000248129  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  32.54 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  29.41 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  27.12 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.87 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2042  nitroreductase  31.47 
 
 
228 aa  77.8  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.335823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  31.43 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  32.18 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  29.41 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0721  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.08 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0629951  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1472  nitroreductase  29.76 
 
 
172 aa  77  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  30.13 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  30.26 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>