More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3299 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  100 
 
 
169 aa  354  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  50.6 
 
 
176 aa  192  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  47.93 
 
 
174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  49.11 
 
 
171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  49.11 
 
 
171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  47.93 
 
 
169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  48.52 
 
 
169 aa  179  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  49.11 
 
 
169 aa  178  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  46.99 
 
 
166 aa  174  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  46.39 
 
 
166 aa  173  8e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  46.15 
 
 
169 aa  169  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  47.06 
 
 
170 aa  163  9e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  43.21 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  39.29 
 
 
173 aa  162  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  43.45 
 
 
173 aa  161  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  39.88 
 
 
173 aa  159  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  44.97 
 
 
169 aa  158  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  39.88 
 
 
173 aa  157  7e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  46.75 
 
 
174 aa  155  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  41.42 
 
 
169 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  43.2 
 
 
169 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  38.69 
 
 
171 aa  141  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  40.48 
 
 
187 aa  141  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  40.36 
 
 
169 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  38.27 
 
 
169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  37.72 
 
 
167 aa  135  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  38.95 
 
 
171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  37.8 
 
 
166 aa  133  9e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  36.47 
 
 
201 aa  131  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  37.65 
 
 
274 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  35.98 
 
 
166 aa  121  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  37.2 
 
 
165 aa  121  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  36.17 
 
 
184 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  30 
 
 
197 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  34.57 
 
 
175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  38.82 
 
 
167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  37.43 
 
 
176 aa  107  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  33.94 
 
 
169 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  36 
 
 
167 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  36.18 
 
 
170 aa  104  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  31.91 
 
 
186 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  35.95 
 
 
176 aa  101  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  32.91 
 
 
176 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  36.31 
 
 
192 aa  101  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  35.23 
 
 
176 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  32.97 
 
 
186 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  34.09 
 
 
186 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.67 
 
 
166 aa  99.8  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  34.81 
 
 
170 aa  98.2  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  31.29 
 
 
180 aa  97.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  33.92 
 
 
187 aa  97.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  32.16 
 
 
171 aa  97.8  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  33.33 
 
 
174 aa  97.4  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  31.61 
 
 
172 aa  95.5  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  32.77 
 
 
194 aa  95.5  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  30.25 
 
 
177 aa  95.1  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  29.94 
 
 
178 aa  94.7  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  29.55 
 
 
188 aa  94.7  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  30 
 
 
170 aa  94.4  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  30.46 
 
 
172 aa  94.4  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  30.68 
 
 
195 aa  94  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  34.84 
 
 
173 aa  93.6  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  31.64 
 
 
194 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  30.13 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  35.09 
 
 
184 aa  93.6  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  28.16 
 
 
176 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  29.45 
 
 
173 aa  93.2  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  30 
 
 
168 aa  91.7  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  30.9 
 
 
188 aa  90.9  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  35.4 
 
 
173 aa  90.9  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  29.48 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  30.34 
 
 
176 aa  89  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  33.14 
 
 
189 aa  88.6  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  28.72 
 
 
191 aa  87.8  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  31.95 
 
 
189 aa  87.4  9e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  32.87 
 
 
176 aa  87  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  31.07 
 
 
178 aa  85.5  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  27.68 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  28.49 
 
 
180 aa  85.1  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  31.95 
 
 
189 aa  84.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  34.23 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  31.87 
 
 
173 aa  84  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  31.37 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  27.27 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  31.55 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  26.95 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  31.54 
 
 
278 aa  81.6  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  36.08 
 
 
177 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  27.01 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  29.07 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  32.64 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  27.94 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  32.76 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  30.17 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  29.07 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  29.3 
 
 
184 aa  79  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  29.52 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.06 
 
 
584 aa  77.8  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  30.13 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  27.33 
 
 
196 aa  77.8  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>