More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1563 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  100 
 
 
173 aa  359  1e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  94.8 
 
 
173 aa  344  4e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  94.22 
 
 
173 aa  342  2e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  82.08 
 
 
173 aa  318  3e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  49.4 
 
 
166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  48.81 
 
 
166 aa  192  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  50.6 
 
 
176 aa  189  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  46.43 
 
 
174 aa  173  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  39.29 
 
 
169 aa  162  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  37.65 
 
 
171 aa  153  9e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  42.77 
 
 
169 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  39.29 
 
 
169 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  44.64 
 
 
174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  39.29 
 
 
169 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  45.24 
 
 
170 aa  147  5e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  40.24 
 
 
169 aa  147  8e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  38.82 
 
 
171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  38.82 
 
 
171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  40.49 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  38.1 
 
 
169 aa  145  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  36.9 
 
 
201 aa  144  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  37.35 
 
 
169 aa  143  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  42.13 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  40.96 
 
 
169 aa  136  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  35.12 
 
 
166 aa  135  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  38.69 
 
 
169 aa  134  8e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  37.5 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  46.3 
 
 
169 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  35.5 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  42.11 
 
 
274 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  33.94 
 
 
197 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  37.5 
 
 
166 aa  120  7e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  35.29 
 
 
170 aa  107  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  33.73 
 
 
169 aa  104  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  33.33 
 
 
165 aa  101  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  33.92 
 
 
182 aa  100  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  33.33 
 
 
186 aa  98.6  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  33.33 
 
 
176 aa  98.2  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  35.33 
 
 
167 aa  97.8  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.86 
 
 
176 aa  97.8  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  32.94 
 
 
173 aa  95.1  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  32.52 
 
 
173 aa  94.7  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  30.11 
 
 
172 aa  94.4  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  33.55 
 
 
167 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  29.55 
 
 
172 aa  93.6  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  29.17 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  30.46 
 
 
175 aa  91.3  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  31.68 
 
 
170 aa  91.3  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  33.52 
 
 
191 aa  90.9  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  90.1  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  31.13 
 
 
180 aa  89  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  32.45 
 
 
186 aa  88.6  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  38.46 
 
 
172 aa  88.6  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  33.76 
 
 
174 aa  87.4  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  28.83 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  31.55 
 
 
184 aa  87  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  32.34 
 
 
175 aa  86.3  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.91 
 
 
186 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  27.68 
 
 
176 aa  84.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  30.46 
 
 
177 aa  85.1  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.41 
 
 
184 aa  84.7  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  29.41 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.72 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  32.34 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  28.21 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  32.48 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  30.92 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  29.12 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  31.66 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  34.81 
 
 
192 aa  82  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  30.13 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  26.01 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  31.85 
 
 
170 aa  80.9  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.86 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  28.66 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  31.1 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  30.53 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  24.88 
 
 
204 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  30.5 
 
 
180 aa  79  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  31.79 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  28.16 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  28.64 
 
 
189 aa  77.4  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  27.27 
 
 
202 aa  77  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.03 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  28.74 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  29.67 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  29.27 
 
 
278 aa  76.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  27.07 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  32.95 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  27.07 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  28.57 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  30.69 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  31.01 
 
 
174 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  26.74 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  33.15 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1387  nitroreductase  28.93 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  29.31 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  32.34 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  30 
 
 
184 aa  72.4  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  31.11 
 
 
178 aa  72  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>