More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0897 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  100 
 
 
192 aa  393  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  50.65 
 
 
174 aa  148  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  47.1 
 
 
175 aa  142  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  43.75 
 
 
175 aa  136  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  45.68 
 
 
170 aa  128  6e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  44.59 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  45.51 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  41.36 
 
 
194 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  41.61 
 
 
194 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  43.24 
 
 
174 aa  117  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  40.61 
 
 
178 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  39.74 
 
 
175 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  36.05 
 
 
176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  38.79 
 
 
176 aa  111  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  44.38 
 
 
175 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  44.1 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  36.52 
 
 
186 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  37.08 
 
 
184 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  40.76 
 
 
169 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  38.06 
 
 
163 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  36.31 
 
 
169 aa  101  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  39.51 
 
 
178 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  33.9 
 
 
186 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  35 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  34.59 
 
 
165 aa  99.8  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  36.94 
 
 
169 aa  99.8  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  33.9 
 
 
186 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  35.19 
 
 
168 aa  96.7  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  36.48 
 
 
174 aa  96.3  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  32.93 
 
 
175 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  36.75 
 
 
167 aa  95.5  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  30.3 
 
 
188 aa  95.5  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  37.74 
 
 
166 aa  94.7  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  37.74 
 
 
166 aa  94.7  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  34.19 
 
 
163 aa  94.4  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  33.13 
 
 
329 aa  93.6  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  34.76 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  33.12 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  33.15 
 
 
278 aa  92  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  35.8 
 
 
170 aa  91.7  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  35.37 
 
 
169 aa  90.9  9e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  39.39 
 
 
174 aa  90.9  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  32.53 
 
 
176 aa  90.1  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  40.12 
 
 
169 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  33.73 
 
 
184 aa  89  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  32.12 
 
 
180 aa  88.2  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  35.62 
 
 
170 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  34.34 
 
 
169 aa  86.3  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  34.15 
 
 
171 aa  85.9  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  34.15 
 
 
171 aa  85.9  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  33.33 
 
 
169 aa  85.9  3e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  33.94 
 
 
274 aa  84  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  37.66 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  32.34 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.53 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1136  nitroreductase  30.05 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.710664  normal  0.0578189 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  33.55 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  34.52 
 
 
167 aa  82  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  30.19 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  34.81 
 
 
173 aa  82  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  36.13 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  30.72 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  27.18 
 
 
221 aa  81.3  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  31.91 
 
 
242 aa  81.3  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  37.01 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  37.01 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  37.01 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  37.01 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  32.53 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  31.87 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  37.01 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0528  NADH dehydrogenase  28.57 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.688745 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  37.66 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  37.01 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  37.66 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  35.48 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  37.01 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  29.47 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  32 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  33.33 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  31.71 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  30.77 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  32.31 
 
 
274 aa  78.6  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  32.62 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  33.5 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  31.21 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  37.66 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  34.73 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  32.9 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  31.48 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  37.66 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  37.66 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  37.5 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  38.31 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  33.33 
 
 
172 aa  77.8  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  31.4 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  37.5 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  29.71 
 
 
261 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  33.54 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  29.07 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>