192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2035 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  100 
 
 		 242 aa  482  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  56.7 
 
 		 202 aa  217  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  49.6 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  46.67 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  53.92 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  44.29 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  54.19 
 
 		 235 aa  187  2e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  47.94 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  46.78 
 
 		 239 aa  181  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  50.97 
 
 		 234 aa  182  6e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  48.72 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  42.5 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  39.7 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  43.43 
 
 		 207 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  42.02 
 
 		 189 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  36.67 
 
 		 251 aa  138  8.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  34.09 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  35.61 
 
 		 382 aa  121  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  40.55 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  35.47 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  37.67 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  36.77 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  32.06 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  34.67 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  30.58 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  32.09 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  35 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  34.26 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  33.17 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  33.8 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  36.84 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  33.33 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  32.55 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  34.41 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  36.52 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  35.27 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  32.84 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  34.85 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  31.68 
 
 		 251 aa  99.4  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  36.5 
 
 		 203 aa  98.6  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  33.5 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  37.79 
 
 		 252 aa  95.5  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  32.12 
 
 		 259 aa  95.5  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  34.48 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  32.66 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  34.65 
 
 		 250 aa  92  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  31.02 
 
 		 508 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  31.02 
 
 		 508 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  32.58 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  31.35 
 
 		 510 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  29.08 
 
 		 202 aa  87  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  37.04 
 
 		 354 aa  85.5  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  29.47 
 
 		 509 aa  84.3  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  29.73 
 
 		 510 aa  82.4  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  31.91 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  34.97 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  30.99 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  33.97 
 
 		 530 aa  80.9  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  29.65 
 
 		 503 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  28.21 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  30.58 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  33.07 
 
 		 523 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  33.9 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  31.03 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  30.88 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  30 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  28.5 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  34.18 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  28.57 
 
 		 1514 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  34.48 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  34.29 
 
 		 236 aa  72  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  30.15 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  32.22 
 
 		 175 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  30.94 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2553  hypothetical protein  23.46 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  hitchhiker  0.0000000044081 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2541  hypothetical protein  24.02 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0273286  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  32.14 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2726  hypothetical protein  24.02 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  28.31 
 
 		 474 aa  68.9  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  31.69 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2736  hypothetical protein  23.46 
 
 		 325 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.78205e-21 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  31.44 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  32.84 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  32.84 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.23 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  31.82 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  33.59 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  40.22 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  30.65 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  32.23 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  37.88 
 
 		 518 aa  65.5  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  29.57 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  25.63 
 
 		 193 aa  65.1  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  31.85 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  31.85 
 
 		 538 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  30.81 
 
 		 473 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  36.27 
 
 		 564 aa  62  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  30.95 
 
 		 221 aa  62  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.33 
 
 		 341 aa  62  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  29 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>