93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0930 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  100 
 
 
218 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  46.88 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  48.94 
 
 
284 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  45.92 
 
 
247 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  55.49 
 
 
219 aa  169  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  46.84 
 
 
249 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  50.54 
 
 
282 aa  164  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  46.53 
 
 
221 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  49.19 
 
 
221 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  45.5 
 
 
222 aa  157  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  47.09 
 
 
217 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  47.09 
 
 
217 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  47.09 
 
 
217 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  47.09 
 
 
217 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  47.09 
 
 
217 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  47.09 
 
 
262 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  47.34 
 
 
305 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  49.21 
 
 
217 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  49.21 
 
 
217 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  46.24 
 
 
217 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  51.16 
 
 
232 aa  148  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  46.81 
 
 
228 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  50.99 
 
 
223 aa  141  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  43.92 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  42.49 
 
 
254 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  39.88 
 
 
218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  38.42 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  38.5 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  32.2 
 
 
234 aa  101  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  34.48 
 
 
235 aa  101  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  33.66 
 
 
274 aa  101  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  31.53 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  30.32 
 
 
221 aa  93.2  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  29.67 
 
 
250 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  32.86 
 
 
205 aa  88.6  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  30.66 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  29.19 
 
 
202 aa  77  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  33.48 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  33.87 
 
 
259 aa  75.1  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  34.03 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  27.18 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  31.09 
 
 
189 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  29.85 
 
 
252 aa  72  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  30.15 
 
 
242 aa  71.6  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  32.61 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  28.44 
 
 
251 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  30.81 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  27.69 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  28.37 
 
 
251 aa  68.2  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  30.46 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.96 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  32.67 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  29.14 
 
 
257 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  28.88 
 
 
253 aa  60.5  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  29.95 
 
 
248 aa  58.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  29.23 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  29.07 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  34.9 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  27.06 
 
 
257 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  29.28 
 
 
252 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  28.88 
 
 
254 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  29.8 
 
 
375 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  25 
 
 
357 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  30.68 
 
 
252 aa  52  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  27.93 
 
 
273 aa  51.6  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  29.53 
 
 
285 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  30.77 
 
 
250 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.07 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  25.7 
 
 
240 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  26.88 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  22.22 
 
 
371 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  28.57 
 
 
256 aa  49.7  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  28.73 
 
 
186 aa  49.3  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  29.56 
 
 
255 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.78 
 
 
186 aa  48.5  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  25.98 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  25.57 
 
 
183 aa  47.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  25.58 
 
 
174 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  28.72 
 
 
259 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  31.73 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  30.16 
 
 
252 aa  45.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  27.5 
 
 
236 aa  45.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  27 
 
 
244 aa  45.8  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  31.12 
 
 
273 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  34.58 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  26.44 
 
 
178 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  29.35 
 
 
304 aa  42.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  27.92 
 
 
273 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  30.11 
 
 
274 aa  42.4  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  30.63 
 
 
250 aa  42.4  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  28.25 
 
 
188 aa  42  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  25.23 
 
 
363 aa  41.6  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  30.93 
 
 
242 aa  41.6  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>