86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0818 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  100 
 
 		 282 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  75.35 
 
 		 284 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  56.22 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  50.54 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  52.82 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  47.5 
 
 		 217 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  47.5 
 
 		 217 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  47.5 
 
 		 217 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  47.5 
 
 		 217 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  47.5 
 
 		 217 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  47.5 
 
 		 262 aa  171  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  47.5 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  47.64 
 
 		 217 aa  168  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  44.1 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  44.88 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  45.03 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  46.49 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  45.36 
 
 		 193 aa  162  5.0000000000000005e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  47.03 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  48.9 
 
 		 232 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  48.91 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  48.91 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  47.18 
 
 		 228 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  48.59 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  42.86 
 
 		 222 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  39.3 
 
 		 202 aa  142  7e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  41.21 
 
 		 218 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  46.45 
 
 		 223 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  33.5 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  33.33 
 
 		 237 aa  97.1  3e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  31.56 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  32.86 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  39.02 
 
 		 202 aa  90.5  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  31.22 
 
 		 221 aa  89.7  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  30.26 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  28.92 
 
 		 205 aa  81.6  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  31.98 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  34.57 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  30.73 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  26.67 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  31.38 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  31.53 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  31.22 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  30.12 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  32.09 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  32.04 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  30.16 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  27.89 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  30.61 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  31.47 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  28.19 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  28.43 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  30 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  30.43 
 
 		 255 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  31.09 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  28.87 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  31.09 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  30.73 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  29.67 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  24.65 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  33.5 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  26.4 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  30.88 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  26.34 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  28.8 
 
 		 248 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  29.26 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  30.26 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.8 
 
 		 184 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  26.52 
 
 		 174 aa  52.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  25.73 
 
 		 174 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  26.18 
 
 		 251 aa  48.5  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  25.5 
 
 		 474 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  24.14 
 
 		 168 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  28.95 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  25.99 
 
 		 186 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.74 
 
 		 186 aa  46.2  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  34.57 
 
 		 242 aa  45.8  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  32.45 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  26.96 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  26.89 
 
 		 391 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  26.92 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  27.32 
 
 		 186 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  24.82 
 
 		 173 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  25.85 
 
 		 167 aa  43.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  23.89 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  25.41 
 
 		 169 aa  42.4  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>