80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5597 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  86.49 
 
 
249 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  72.99 
 
 
221 aa  323  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  72.04 
 
 
221 aa  322  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  72.99 
 
 
305 aa  317  9e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  72.99 
 
 
262 aa  317  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  72.99 
 
 
217 aa  316  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  72.99 
 
 
217 aa  316  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  72.99 
 
 
217 aa  316  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  72.99 
 
 
217 aa  316  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  72.99 
 
 
217 aa  316  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  72.99 
 
 
217 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  61.14 
 
 
217 aa  250  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  61.14 
 
 
217 aa  250  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  55.25 
 
 
222 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  53.16 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  50 
 
 
232 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  49.75 
 
 
228 aa  175  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  50.25 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  46.81 
 
 
284 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  46.2 
 
 
247 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  45.5 
 
 
218 aa  157  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  44.1 
 
 
282 aa  154  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  45.41 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  42.63 
 
 
254 aa  132  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  35.87 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  42.29 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  35.68 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  36.68 
 
 
235 aa  100  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  33.83 
 
 
237 aa  94  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  33.83 
 
 
234 aa  92.4  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  35.57 
 
 
202 aa  91.7  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  33.67 
 
 
274 aa  91.3  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  26.96 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  31.47 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  32 
 
 
189 aa  85.5  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  30.81 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  29.06 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  34.17 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  33.33 
 
 
382 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  29.65 
 
 
207 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  31.52 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  32.18 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  29.21 
 
 
253 aa  68.6  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  31.44 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  31.58 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  31.28 
 
 
256 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  25.85 
 
 
251 aa  63.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  27.8 
 
 
252 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  29.3 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  29.13 
 
 
257 aa  59.7  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  26.76 
 
 
246 aa  56.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  29.82 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  31.79 
 
 
255 aa  55.5  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  29.41 
 
 
252 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  27.88 
 
 
357 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  26.55 
 
 
252 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  27.72 
 
 
246 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  23.83 
 
 
371 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  34.38 
 
 
203 aa  52  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  30.26 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  29.05 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  30.69 
 
 
375 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  35.96 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.05 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  31.6 
 
 
252 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  26.39 
 
 
3002 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  28.3 
 
 
257 aa  45.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  30.08 
 
 
475 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  27.17 
 
 
243 aa  45.4  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  31.25 
 
 
236 aa  45.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  29.5 
 
 
248 aa  45.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.51 
 
 
461 aa  45.1  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  28.77 
 
 
363 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  28.22 
 
 
250 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  24.38 
 
 
3021 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  30.29 
 
 
285 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  24.39 
 
 
513 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  25.61 
 
 
513 aa  42  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  26.78 
 
 
203 aa  42  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>