146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4195 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  100 
 
 		 259 aa  517  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  35.51 
 
 		 382 aa  132  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  38.76 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  36.84 
 
 		 375 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  39.3 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  35.23 
 
 		 202 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  39.2 
 
 		 274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  38.61 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  36.63 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  32.28 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  33.7 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  31.05 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  32.09 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  30.61 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  37.81 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  36.05 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  28.71 
 
 		 236 aa  99  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  37.82 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  36.76 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  34.16 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  32.12 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  34.54 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  32.16 
 
 		 205 aa  92.8  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  31.55 
 
 		 392 aa  91.7  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  31.89 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  33.33 
 
 		 503 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  36.26 
 
 		 242 aa  88.6  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  36.06 
 
 		 492 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  30.65 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  30.23 
 
 		 547 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  30.86 
 
 		 523 aa  85.1  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  29.85 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.5 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  30.73 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  31.37 
 
 		 356 aa  82.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  31.96 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  29.22 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  31.1 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  34.13 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  29.32 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  29.32 
 
 		 508 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  27.73 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  31.72 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  29.94 
 
 		 509 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  32.29 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  32.96 
 
 		 518 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  23.9 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  26.46 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  33.87 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  33.56 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  33.1 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  30.13 
 
 		 551 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  30.13 
 
 		 538 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  31.35 
 
 		 3021 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  30.12 
 
 		 556 aa  72.8  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  31.79 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.27 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  31.47 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  31.69 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  29.6 
 
 		 546 aa  69.7  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  31.25 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  28.72 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  32.64 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  27.31 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  30 
 
 		 558 aa  67.4  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  31.73 
 
 		 2454 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  34.04 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  29.76 
 
 		 473 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  32.39 
 
 		 203 aa  65.1  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  27.18 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0919  hypothetical protein  29.73 
 
 		 610 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  30.15 
 
 		 656 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  27.08 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  28.14 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  26.83 
 
 		 514 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  28.49 
 
 		 513 aa  62.4  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  28.49 
 
 		 513 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  28.49 
 
 		 513 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  28.49 
 
 		 513 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  26.34 
 
 		 513 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  28.49 
 
 		 513 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  27.14 
 
 		 513 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  31.11 
 
 		 526 aa  62.4  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  33.56 
 
 		 518 aa  62  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  27.59 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  29.65 
 
 		 532 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  28.3 
 
 		 3002 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  32.34 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  30.17 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  26.74 
 
 		 513 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  30.51 
 
 		 602 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  23.83 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  27.23 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  30.36 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  28.43 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3691  hypothetical protein  27.23 
 
 		 551 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392558  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  34.51 
 
 		 529 aa  56.6  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  30.06 
 
 		 520 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0645  hypothetical protein  29.03 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1165  hypothetical protein  32.56 
 
 		 531 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>