More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3098 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3098  nitroreductase  100 
 
 
304 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2655  nitroreductase  56.1 
 
 
273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.263589  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4153  nitroreductase  46.83 
 
 
273 aa  219  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000365143  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1372  nitroreductase family protein  53.78 
 
 
273 aa  217  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5299  nitroreductase  54.96 
 
 
274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.367904  normal  0.0165662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3290  putative nitroreductase family protein  48.1 
 
 
284 aa  212  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  45.83 
 
 
273 aa  208  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1130  nitroreductase  50.55 
 
 
286 aa  201  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7190  Nitroreductase  49.59 
 
 
253 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0516  nitroreductase  52.87 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1852  nitroreductase  46.75 
 
 
288 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1161  nitroreductase  54.36 
 
 
273 aa  192  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.395366  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45940  Nitroreductase-like protein  53.65 
 
 
273 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2490  nitroreductase family protein  49.38 
 
 
274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  38.19 
 
 
285 aa  171  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2607  nitroreductase  37.67 
 
 
253 aa  155  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.921549  normal  0.767551 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  36.14 
 
 
240 aa  153  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06664  nitroreductase A  34.68 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0430  nitroreductase  37.8 
 
 
251 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000330176  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0441  nitroreductase  37.8 
 
 
251 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000237608  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  33.33 
 
 
248 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1336  nitroreductase  34.69 
 
 
244 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0249  nitroreductase A  37.84 
 
 
240 aa  135  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.807471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3660  nitroreductase family protein  34.02 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.930381  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1500  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  34.44 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00104852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1532  nitroreductase  37.81 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.509965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1713  nitroreductase family protein  34.02 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  31.66 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1491  oxygen-insensitive NADPH nitroreductase  34.02 
 
 
244 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1365  nitroreductase A  37.93 
 
 
240 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1682  nitroreductase family protein  34.02 
 
 
244 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1790  nitroreductase family protein  38.31 
 
 
244 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1528  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  33.61 
 
 
244 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1647  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  33.61 
 
 
244 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1736  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  34.02 
 
 
244 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0685688  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1106  nitro/flavin reductase  38.43 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000115125  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0062  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  38.01 
 
 
251 aa  130  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.454092  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  38.81 
 
 
243 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0996  nitroreductase  32.69 
 
 
250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0954  nitroreductase A  37.86 
 
 
240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2745  nitroreductase A  37.86 
 
 
240 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.154506 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1005  nitroreductase A  37.86 
 
 
240 aa  126  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224676 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2492  nitroreductase  40.78 
 
 
249 aa  126  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0878  nitroreductase A  38.35 
 
 
240 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2481  nitroreductase A  37.86 
 
 
240 aa  125  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0613  NADPH-flavin oxidoreductase  35.29 
 
 
251 aa  125  7e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00207228  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00856  nitroreductase A, NADPH-dependent, FMN-dependent  37.86 
 
 
240 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2791  nitroreductase  37.86 
 
 
240 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0923  nitroreductase A  37.86 
 
 
240 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00862  hypothetical protein  37.86 
 
 
240 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0493  nitroreductase  29.32 
 
 
269 aa  124  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1079  nitroreductase A  32.64 
 
 
240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  33.94 
 
 
246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1245  nitroreductase A  33.33 
 
 
242 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1955  nitroreductase A  36.7 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.45348  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2290  nitroreductase  39.82 
 
 
240 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2389  nitroreductase  41.12 
 
 
240 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0911  nitroreductase A  37.2 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0947  nitroreductase A  37.2 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1008  nitroreductase A  37.2 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0979  nitroreductase A  37.2 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.711785  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1689  nitroreductase A  37.22 
 
 
239 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.589123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  32.85 
 
 
246 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1027  nitroreductase A  36.71 
 
 
240 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.515962  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0338  nitroreductase  31.31 
 
 
246 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1309  nitroreductase family protein  31.8 
 
 
299 aa  107  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0797  nitroreductase  32.43 
 
 
240 aa  106  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0381  nitroreductase  31.31 
 
 
246 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1560  nitroreductase  31.37 
 
 
253 aa  103  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0391  nitroreductase  36.61 
 
 
316 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1502  Nitroreductase  34.47 
 
 
254 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1816  nitroreductase  37.12 
 
 
238 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.545584 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1072  nitroreductase  33.17 
 
 
251 aa  99.8  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1439  nitroreductase  37.7 
 
 
238 aa  96.3  6e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3965  nitroreductase  32.11 
 
 
265 aa  93.6  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.696228 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2300  nitroreductase  33.71 
 
 
317 aa  90.9  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0351081 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  36.25 
 
 
174 aa  88.2  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8680  nitroreductase  36.78 
 
 
282 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281057  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1770  nitroreductase  27.75 
 
 
247 aa  84  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0755  nitroreductase  28.85 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  34.86 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  33.51 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1230  nitroreductase  25.37 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  37.5 
 
 
174 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  30.65 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.27 
 
 
584 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1003  nitroreductase  34.59 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.91406  hitchhiker  0.00384505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  32.72 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  28.49 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.95 
 
 
204 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  36.59 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0889  nitroreductase  36.73 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.351311 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  32.24 
 
 
183 aa  72  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  28.57 
 
 
169 aa  72  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30.57 
 
 
186 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  28.33 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.56 
 
 
176 aa  71.2  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.12 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  41.86 
 
 
206 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  26.07 
 
 
215 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>