155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4232 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  100 
 
 		 250 aa  500  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  47.09 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  36.82 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  32.06 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  30.05 
 
 		 221 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  34.65 
 
 		 242 aa  98.2  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  33.33 
 
 		 225 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  34.51 
 
 		 237 aa  92  8e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  35.82 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  34.88 
 
 		 249 aa  90.1  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  29.72 
 
 		 251 aa  87.8  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  32.04 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  36.41 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  33.01 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  27.05 
 
 		 236 aa  87  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  34.1 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.69 
 
 		 207 aa  87  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  32.09 
 
 		 274 aa  85.9  5e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  31.19 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  32.24 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  26.67 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  32.99 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  35.06 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  28.26 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  26.18 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  34.04 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  27.45 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  32.35 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  25 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  31.31 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  32.61 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  29.38 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  31.38 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  36.15 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  29.86 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  30.48 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  25.53 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  30.37 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  29.85 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  26.49 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  27.27 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  31.16 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  31.16 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  29.3 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  29.72 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  29.69 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  29.71 
 
 		 503 aa  62.4  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  30.77 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  32.46 
 
 		 474 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  28.93 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.02 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2589  hypothetical protein  30.14 
 
 		 537 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0423242  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  30.05 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  34.1 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  26.2 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  26.84 
 
 		 3002 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.26 
 
 		 391 aa  58.9  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  28.24 
 
 		 514 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.62 
 
 		 530 aa  58.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  25.67 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  33.33 
 
 		 508 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  33.33 
 
 		 508 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  34.07 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  27.49 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  22.61 
 
 		 510 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0920  hypothetical protein  32.74 
 
 		 240 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  24.62 
 
 		 510 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0645  hypothetical protein  33.04 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  33.17 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  27.08 
 
 		 375 aa  55.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  30.77 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4206  nitroreductase  29.21 
 
 		 531 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  30.24 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2434  hypothetical protein  32.35 
 
 		 538 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210466  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  31.19 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  31.37 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  26.98 
 
 		 475 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  28.37 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0919  hypothetical protein  26.98 
 
 		 610 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  29.85 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  29.81 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  35.79 
 
 		 656 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  30.32 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  27.64 
 
 		 471 aa  53.5  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  26.32 
 
 		 513 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3691  hypothetical protein  26.45 
 
 		 551 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  29.56 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  27.19 
 
 		 491 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  33.33 
 
 		 538 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  33.33 
 
 		 551 aa  52.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  27.21 
 
 		 526 aa  52.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  28.08 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  27.44 
 
 		 513 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  25.44 
 
 		 520 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  31.33 
 
 		 363 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  36.96 
 
 		 529 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  23.56 
 
 		 1514 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  25.44 
 
 		 513 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  30.81 
 
 		 546 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  25.44 
 
 		 513 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>