67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A2324 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  100 
 
 
262 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  435  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  92.13 
 
 
217 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  68.35 
 
 
249 aa  325  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  72.99 
 
 
222 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  69.19 
 
 
221 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  68.72 
 
 
221 aa  301  9e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  66.51 
 
 
217 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  66.51 
 
 
217 aa  278  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  58.33 
 
 
222 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  49.73 
 
 
247 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  51.83 
 
 
284 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  50.76 
 
 
228 aa  175  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  50.76 
 
 
219 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  49.49 
 
 
232 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  50.52 
 
 
223 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  47.03 
 
 
282 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  47.34 
 
 
218 aa  155  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  44.15 
 
 
217 aa  139  7.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  41.33 
 
 
254 aa  125  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  40.45 
 
 
218 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  37.1 
 
 
202 aa  116  5e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  36.5 
 
 
193 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
205 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  32.8 
 
 
189 aa  92.4  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  31.34 
 
 
205 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  34.48 
 
 
235 aa  90.5  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  33.49 
 
 
274 aa  89.7  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  33.33 
 
 
234 aa  87  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  33 
 
 
237 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  34.36 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  27.72 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  25.71 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  32.83 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  28.44 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  30 
 
 
254 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  30.85 
 
 
249 aa  63.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  31.88 
 
 
239 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  28.87 
 
 
207 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  31.87 
 
 
236 aa  60.5  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  30.96 
 
 
225 aa  59.7  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  29.56 
 
 
256 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  29.08 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  29.1 
 
 
252 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  28.02 
 
 
246 aa  53.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  26.91 
 
 
257 aa  52.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  28.04 
 
 
255 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  26.63 
 
 
207 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  26.94 
 
 
357 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  28.8 
 
 
252 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  27.04 
 
 
471 aa  48.5  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  26.82 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  26.29 
 
 
246 aa  47.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  28.27 
 
 
257 aa  47  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  27.45 
 
 
251 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  30.18 
 
 
253 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  23.59 
 
 
371 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  29.41 
 
 
248 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  29.41 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  29.38 
 
 
259 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08360  conserved hypothetical protein  34.26 
 
 
285 aa  42.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.811217  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  27.43 
 
 
513 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>