181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2599 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  100 
 
 
225 aa  438  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  44.33 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  42.35 
 
 
221 aa  182  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  48.97 
 
 
202 aa  174  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  45.64 
 
 
207 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  47.78 
 
 
234 aa  171  6.999999999999999e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  48.72 
 
 
242 aa  169  4e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  46.67 
 
 
274 aa  169  4e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  46.08 
 
 
237 aa  165  4e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  49.01 
 
 
235 aa  165  5e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  45.77 
 
 
239 aa  150  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  35.86 
 
 
205 aa  141  9e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  34 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  35.48 
 
 
189 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  39.7 
 
 
207 aa  131  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  38.39 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  35.55 
 
 
246 aa  125  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  34.5 
 
 
236 aa  124  9e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  33.17 
 
 
246 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  39.39 
 
 
259 aa  123  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  40 
 
 
382 aa  123  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  38.86 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  41.38 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  38.38 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  33.97 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  32.23 
 
 
251 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  36.07 
 
 
257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  36.62 
 
 
255 aa  113  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  41.92 
 
 
242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  35.9 
 
 
256 aa  112  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  35.41 
 
 
254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  36.5 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  36.15 
 
 
255 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  32.51 
 
 
252 aa  108  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  38.07 
 
 
249 aa  105  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  41.5 
 
 
244 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
257 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  36.36 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  32.74 
 
 
203 aa  99.4  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  37.82 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  30.52 
 
 
251 aa  96.3  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  34.34 
 
 
247 aa  93.2  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  39.02 
 
 
252 aa  92  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  33.7 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  30.77 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  33.33 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  34.13 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  34.62 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  29.35 
 
 
508 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  29.35 
 
 
508 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  29.67 
 
 
357 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  34.74 
 
 
356 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  34.09 
 
 
523 aa  78.2  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  34.63 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  34.62 
 
 
510 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  37.32 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  37.44 
 
 
518 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  31.31 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  27.81 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  28.36 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  33.52 
 
 
284 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  26.82 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  27.32 
 
 
193 aa  72  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  31.38 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.61 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  31.58 
 
 
510 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  31.11 
 
 
3021 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.11 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.32 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  34.38 
 
 
503 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  32.18 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  29.6 
 
 
458 aa  68.6  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  33.66 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  30.48 
 
 
3002 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  33.33 
 
 
363 aa  68.2  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  25.76 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  33.08 
 
 
509 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  30.2 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  29.44 
 
 
266 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  34.07 
 
 
518 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  30.61 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  32.38 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  31.53 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  32.67 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  28.42 
 
 
473 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  30.9 
 
 
491 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  32 
 
 
461 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  33.83 
 
 
556 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  32.06 
 
 
656 aa  61.6  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  26.84 
 
 
180 aa  61.2  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  31 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  31 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  31 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  31 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  31 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  29.85 
 
 
249 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  30.96 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  30.96 
 
 
305 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  32.03 
 
 
529 aa  60.1  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  26.11 
 
 
474 aa  59.3  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>