142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0543 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  520  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  67.72 
 
 		 255 aa  356  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  67.34 
 
 		 252 aa  347  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  67.46 
 
 		 252 aa  331  8e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  59.84 
 
 		 253 aa  291  6e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  58.09 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  58.61 
 
 		 252 aa  263  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  56.1 
 
 		 255 aa  261  8e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  55.28 
 
 		 257 aa  258  9e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  53.5 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  45.96 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  45.18 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  44.86 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  44.49 
 
 		 236 aa  201  8e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  47.11 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  44.64 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  50 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  43.67 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  48.26 
 
 		 203 aa  182  7e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  40.97 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  40.58 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  39.09 
 
 		 251 aa  162  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  35.04 
 
 		 382 aa  128  7.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  38.95 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  37.61 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  33.01 
 
 		 221 aa  122  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  38.59 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  42.94 
 
 		 242 aa  111  9e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  35.41 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  39.09 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  33.8 
 
 		 242 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  37.63 
 
 		 274 aa  105  6e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  33.7 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  35.48 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  35.42 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  32.27 
 
 		 214 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  33.16 
 
 		 356 aa  99.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.84 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  35.94 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.61 
 
 		 391 aa  92.4  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  25.89 
 
 		 371 aa  91.7  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  31.79 
 
 		 189 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  31.25 
 
 		 205 aa  89.4  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  31.21 
 
 		 205 aa  85.5  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  33.77 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  30.77 
 
 		 508 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  30.77 
 
 		 508 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  30.85 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  25.97 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  31.89 
 
 		 510 aa  75.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  27.48 
 
 		 474 aa  75.1  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  30.32 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  29.1 
 
 		 509 aa  72  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  31.79 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  30.26 
 
 		 503 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  27.16 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  28.89 
 
 		 656 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  25.25 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  28 
 
 		 523 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  27.96 
 
 		 458 aa  65.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  31.11 
 
 		 529 aa  65.5  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  29.95 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  31.07 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  30.7 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  28.04 
 
 		 518 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  32.04 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  28.04 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  30 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  30 
 
 		 217 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  30 
 
 		 217 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  30 
 
 		 217 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  30 
 
 		 217 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  30 
 
 		 217 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  30 
 
 		 305 aa  62  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  32.56 
 
 		 491 aa  62  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  25.12 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  30.66 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  29.21 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  28.49 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  29.3 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  31.31 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  30.65 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  27.22 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  27.22 
 
 		 513 aa  59.3  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  27.22 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  27.22 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  32.17 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  27.19 
 
 		 473 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  26.51 
 
 		 547 aa  58.9  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  27.22 
 
 		 513 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  26.63 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  31.08 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  30 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  33.33 
 
 		 492 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  29.94 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  28.88 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  29.3 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  28.65 
 
 		 518 aa  56.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  28.85 
 
 		 532 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>