107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0933 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  423  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  49.26 
 
 		 253 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  50 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  52.26 
 
 		 256 aa  190  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  47.76 
 
 		 255 aa  190  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  49.03 
 
 		 255 aa  189  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  51.67 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  52.26 
 
 		 252 aa  185  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  50 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  48.26 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  48.95 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  46.46 
 
 		 236 aa  174  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  45.3 
 
 		 252 aa  170  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  48.35 
 
 		 251 aa  169  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  42.42 
 
 		 257 aa  167  8e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  44.51 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  42.42 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  45.16 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  43.96 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  46.77 
 
 		 259 aa  154  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  38.46 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  39.62 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  41.22 
 
 		 202 aa  115  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  39.62 
 
 		 221 aa  111  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  36.52 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  34.97 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  37.06 
 
 		 382 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  32.74 
 
 		 225 aa  99.4  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  36.57 
 
 		 274 aa  98.6  6e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  35.96 
 
 		 239 aa  96.7  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  34.66 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  37.5 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  38.6 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  36.25 
 
 		 242 aa  91.3  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  34.38 
 
 		 205 aa  88.2  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  35 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  35.62 
 
 		 189 aa  85.1  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  30.77 
 
 		 371 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  33.08 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  28.85 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  30.82 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.11 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  29.5 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  27.51 
 
 		 356 aa  71.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  25.37 
 
 		 266 aa  68.2  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  32.39 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  30.32 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  24.46 
 
 		 474 aa  63.2  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.62 
 
 		 391 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  30.2 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  32.67 
 
 		 510 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  33.06 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  24.47 
 
 		 475 aa  58.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.43 
 
 		 461 aa  58.9  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  28.66 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  34.9 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  32.67 
 
 		 508 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  32.67 
 
 		 508 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  33.33 
 
 		 529 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  27.78 
 
 		 510 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  33.08 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  25.58 
 
 		 473 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  29.69 
 
 		 547 aa  52.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  34.38 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  28.23 
 
 		 503 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.52 
 
 		 341 aa  52  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  29.41 
 
 		 656 aa  52  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  30.37 
 
 		 523 aa  51.2  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  28.16 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  27.15 
 
 		 458 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  26.9 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  27.82 
 
 		 551 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  27.82 
 
 		 538 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  27.78 
 
 		 509 aa  49.7  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  27.01 
 
 		 363 aa  48.1  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  24.31 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  27.54 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  29.87 
 
 		 2454 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  24.39 
 
 		 513 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  24.39 
 
 		 513 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  24.39 
 
 		 513 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  24.39 
 
 		 513 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  29.37 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  24.14 
 
 		 556 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  28.57 
 
 		 254 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  24.39 
 
 		 513 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  27.5 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  28.87 
 
 		 559 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  24.44 
 
 		 526 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  25.98 
 
 		 513 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  25.98 
 
 		 491 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  27.55 
 
 		 558 aa  45.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  29.59 
 
 		 229 aa  45.4  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  27.33 
 
 		 491 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  26.06 
 
 		 602 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  21.76 
 
 		 518 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  22.22 
 
 		 513 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  30.56 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  30.39 
 
 		 564 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  22.22 
 
 		 513 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>