133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1424 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  100 
 
 
252 aa  524  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  80.48 
 
 
253 aa  430  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  78.09 
 
 
256 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  61.98 
 
 
255 aa  293  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  60.74 
 
 
257 aa  290  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  58.61 
 
 
254 aa  279  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  54.88 
 
 
249 aa  277  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  58.51 
 
 
252 aa  276  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  60.58 
 
 
252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  56.97 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  53.98 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  47.72 
 
 
246 aa  225  6e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  50.44 
 
 
251 aa  218  5e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  48.07 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  46.31 
 
 
248 aa  207  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  45.45 
 
 
236 aa  205  5e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  47.21 
 
 
257 aa  202  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  52.26 
 
 
203 aa  202  6e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  44.44 
 
 
252 aa  195  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  48.03 
 
 
259 aa  189  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  38.49 
 
 
246 aa  166  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  37.66 
 
 
251 aa  163  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  40.09 
 
 
382 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  35.91 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  36.19 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  38.86 
 
 
225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  33.17 
 
 
202 aa  121  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  38.02 
 
 
244 aa  121  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  35 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  40.55 
 
 
242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  33.5 
 
 
207 aa  118  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  36.68 
 
 
274 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  36.89 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  37.81 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  36.87 
 
 
234 aa  112  5e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  36.87 
 
 
237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  33.81 
 
 
207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  31.47 
 
 
205 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  32.58 
 
 
189 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  29.8 
 
 
356 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  30.67 
 
 
371 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  31.43 
 
 
214 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  31.67 
 
 
205 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  29.38 
 
 
375 aa  85.5  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.66 
 
 
391 aa  85.5  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  32.69 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  31.75 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  31.75 
 
 
508 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  30 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  26.26 
 
 
357 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  29.47 
 
 
510 aa  76.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.25 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  30.16 
 
 
510 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  31.89 
 
 
523 aa  76.3  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  29.47 
 
 
509 aa  75.5  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  27.6 
 
 
475 aa  73.6  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  28.14 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 
656 aa  70.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  24.26 
 
 
474 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  28.42 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  30 
 
 
354 aa  69.3  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  33.33 
 
 
491 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  28.11 
 
 
458 aa  68.9  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  28.43 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  24.55 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  29.56 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  31.09 
 
 
282 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  27.46 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  30.14 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  24.55 
 
 
502 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  30.52 
 
 
363 aa  65.9  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  30.68 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  28.34 
 
 
503 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  29.12 
 
 
547 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  27.83 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  30.88 
 
 
529 aa  63.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  26.64 
 
 
221 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  29.41 
 
 
222 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  34.15 
 
 
532 aa  62  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  26.83 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  25 
 
 
518 aa  60.5  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  30.11 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.77 
 
 
461 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  32.45 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  29.52 
 
 
492 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  28.27 
 
 
217 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  27.8 
 
 
473 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  31.06 
 
 
217 aa  59.3  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  30.48 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  29.68 
 
 
551 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  29.68 
 
 
538 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  26.34 
 
 
1514 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  26.74 
 
 
556 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  31.4 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  28.8 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  28.8 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  28.8 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  28.8 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  28.8 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  28.8 
 
 
305 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>