110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0217 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  100 
 
 
202 aa  419  1e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  46.7 
 
 
193 aa  179  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  38.12 
 
 
284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  38.42 
 
 
282 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  36.02 
 
 
247 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  38.42 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  36.7 
 
 
217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  36.51 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  36.51 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  36.51 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  36.51 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  36.51 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  36.51 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  36.51 
 
 
305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  35.87 
 
 
222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  34.04 
 
 
249 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  36.14 
 
 
254 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  35.68 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  37.1 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  35.14 
 
 
232 aa  111  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  36.52 
 
 
219 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  31.28 
 
 
218 aa  111  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  35.14 
 
 
221 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  37.57 
 
 
217 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  37.57 
 
 
217 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  32.64 
 
 
228 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  30.66 
 
 
235 aa  101  9e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  32.98 
 
 
223 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  28.7 
 
 
237 aa  98.2  8e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  28.77 
 
 
274 aa  90.5  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  32.09 
 
 
221 aa  90.5  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  28.64 
 
 
234 aa  88.6  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  29.53 
 
 
202 aa  87.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  29.08 
 
 
242 aa  86.3  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  32.76 
 
 
207 aa  85.5  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  29.33 
 
 
222 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  28.99 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  29.67 
 
 
382 aa  78.6  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  27.86 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  26.82 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  25.76 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  27.27 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  26.23 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  28.36 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.59 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  28.88 
 
 
257 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  31.36 
 
 
257 aa  62  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  28.34 
 
 
249 aa  60.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  30.65 
 
 
254 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  24.62 
 
 
371 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  30.14 
 
 
252 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  27.96 
 
 
252 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  25.4 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  27.78 
 
 
248 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  27.75 
 
 
176 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  27.13 
 
 
251 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  25.65 
 
 
184 aa  55.1  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  27.98 
 
 
255 aa  55.1  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  27.08 
 
 
255 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  26.34 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  27.42 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  24.47 
 
 
474 aa  53.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  25.91 
 
 
357 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  25.54 
 
 
375 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  25.87 
 
 
252 aa  52.4  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  29.19 
 
 
256 aa  51.6  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  26.01 
 
 
3021 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  25.29 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  26.29 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  25.58 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  24.71 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  25.97 
 
 
514 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  26.01 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  33.71 
 
 
223 aa  48.5  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  28.19 
 
 
246 aa  48.5  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  26.37 
 
 
354 aa  48.1  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  25.42 
 
 
172 aa  48.1  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  22.28 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  25.14 
 
 
3739 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  26.28 
 
 
278 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  24.02 
 
 
475 aa  46.6  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  27.27 
 
 
253 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  25.51 
 
 
221 aa  45.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  20.69 
 
 
217 aa  45.8  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  27.23 
 
 
242 aa  45.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  24.32 
 
 
526 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  25.29 
 
 
248 aa  45.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  20.57 
 
 
174 aa  45.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  22.16 
 
 
180 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  23.56 
 
 
180 aa  45.1  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  22.99 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  23.4 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  22.61 
 
 
1514 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  22.41 
 
 
188 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24750  nitroreductase  21.14 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  21.02 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  26.6 
 
 
246 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  25.69 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  23.53 
 
 
259 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  25.19 
 
 
170 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>