186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0318 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  100 
 
 
239 aa  478  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  53.99 
 
 
237 aa  204  9e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  45.85 
 
 
221 aa  202  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  53.33 
 
 
274 aa  201  9e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  51.92 
 
 
234 aa  198  6e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  42.26 
 
 
250 aa  198  6e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  50.75 
 
 
202 aa  196  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  50.75 
 
 
242 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  53.62 
 
 
235 aa  187  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  45.77 
 
 
207 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  48.02 
 
 
205 aa  182  6e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  46.53 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  47.12 
 
 
189 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  45.77 
 
 
225 aa  161  8.000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  43.72 
 
 
207 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  38.54 
 
 
251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  34.95 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  33.65 
 
 
252 aa  125  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  38.54 
 
 
382 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  38.61 
 
 
259 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  38.99 
 
 
244 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  36.65 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  36.76 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  37.81 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  32.84 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  38.51 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  37.57 
 
 
252 aa  116  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  39.18 
 
 
259 aa  115  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  39.13 
 
 
214 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  33.85 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  35.82 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  35.48 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  37.5 
 
 
255 aa  108  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  35.83 
 
 
257 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  33.65 
 
 
255 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  34.03 
 
 
508 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  36.89 
 
 
252 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  34.03 
 
 
508 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  33.48 
 
 
375 aa  105  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  30.38 
 
 
357 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  38.46 
 
 
256 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  32.28 
 
 
246 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  35.96 
 
 
203 aa  103  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  38.62 
 
 
354 aa  102  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  33.33 
 
 
510 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  35.57 
 
 
503 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  32.11 
 
 
510 aa  99.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  41.76 
 
 
242 aa  98.2  9e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  36.84 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  32.47 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  30.93 
 
 
509 aa  94.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  35.82 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  31.38 
 
 
523 aa  90.5  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  37.11 
 
 
203 aa  89.4  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  27.67 
 
 
371 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  32.99 
 
 
356 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  34.03 
 
 
218 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  37.64 
 
 
530 aa  85.1  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  33.33 
 
 
518 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  32 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  28.85 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  33.17 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  28.36 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  33.67 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  31.53 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  33.5 
 
 
221 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  31.84 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  30.18 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  35.39 
 
 
254 aa  77  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  34.46 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  32.16 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  31.66 
 
 
262 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  32.5 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  32.66 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  31.66 
 
 
305 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  31.66 
 
 
217 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  31.98 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  31.66 
 
 
217 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  31.66 
 
 
217 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  31.66 
 
 
217 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  31.66 
 
 
217 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  36.96 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  32.09 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.85 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2541  hypothetical protein  24.74 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0273286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2726  hypothetical protein  24.74 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  39.01 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  32.09 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  31.03 
 
 
458 aa  69.3  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  31.63 
 
 
392 aa  68.9  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2736  hypothetical protein  24.21 
 
 
325 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.78205e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2553  hypothetical protein  23.68 
 
 
325 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  hitchhiker  0.0000000044081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  35.64 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  35.64 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  24.46 
 
 
1514 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  37.62 
 
 
175 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  31.43 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  28.87 
 
 
475 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  28.95 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2589  hypothetical protein  33.65 
 
 
537 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0423242  normal  0.130609 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>