64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2589 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2434  hypothetical protein  89.78 
 
 
538 aa  911    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210466  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2589  hypothetical protein  100 
 
 
537 aa  1066    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0423242  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3691  hypothetical protein  52.96 
 
 
551 aa  518  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392558  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4206  nitroreductase  45.64 
 
 
531 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  27.47 
 
 
526 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  23.87 
 
 
514 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  24.28 
 
 
513 aa  107  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  23.95 
 
 
513 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  24.13 
 
 
513 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  24.28 
 
 
513 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  24.28 
 
 
513 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  24.28 
 
 
513 aa  107  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  24.28 
 
 
513 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  24.13 
 
 
513 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  23.18 
 
 
520 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  23.38 
 
 
491 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  24.68 
 
 
510 aa  83.6  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.18 
 
 
530 aa  73.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  24.67 
 
 
503 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  22.42 
 
 
508 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  22.42 
 
 
508 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  23.88 
 
 
509 aa  64.3  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  23.77 
 
 
510 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  26.33 
 
 
518 aa  63.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0920  hypothetical protein  31.43 
 
 
240 aa  60.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  33.65 
 
 
239 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  31.61 
 
 
214 aa  60.1  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  21.69 
 
 
523 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  27.75 
 
 
236 aa  57.4  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  30.41 
 
 
242 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  26.4 
 
 
221 aa  54.7  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  25.79 
 
 
382 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  23.23 
 
 
475 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  31.21 
 
 
250 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  22.86 
 
 
392 aa  52.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.26 
 
 
461 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  31.02 
 
 
3002 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  25.24 
 
 
248 aa  50.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.23 
 
 
391 aa  50.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  26.42 
 
 
259 aa  50.4  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  34.5 
 
 
274 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  29.41 
 
 
235 aa  49.7  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  28.18 
 
 
458 aa  49.3  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  25.14 
 
 
547 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  29.85 
 
 
564 aa  48.9  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  27.21 
 
 
656 aa  48.5  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  27.66 
 
 
556 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  28.47 
 
 
207 aa  47.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  27.23 
 
 
473 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  25.12 
 
 
253 aa  47.4  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  24.48 
 
 
251 aa  47.4  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  27.45 
 
 
474 aa  47  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  30 
 
 
356 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  23.12 
 
 
236 aa  46.2  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  24.55 
 
 
249 aa  46.2  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  32.86 
 
 
234 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  28.23 
 
 
529 aa  45.8  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  29.13 
 
 
202 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  27.61 
 
 
357 aa  45.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  25 
 
 
246 aa  44.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1772  nitroreductase  24.37 
 
 
536 aa  44.3  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  28.19 
 
 
502 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  32.32 
 
 
1514 aa  43.5  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  26.09 
 
 
3021 aa  43.5  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>