124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0254 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  70.62 
 
 
510 aa  751    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  74.21 
 
 
508 aa  743    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  65.94 
 
 
523 aa  687    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  69.47 
 
 
509 aa  731    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  74.21 
 
 
508 aa  743    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  100 
 
 
510 aa  1049    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  65.16 
 
 
503 aa  666    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.07 
 
 
530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  27.53 
 
 
518 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  25.83 
 
 
431 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  26.56 
 
 
656 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  27.45 
 
 
551 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  27.45 
 
 
538 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3945  hypothetical protein  24.65 
 
 
428 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0479721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12860  hypothetical protein  25.23 
 
 
531 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.742525 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  25.41 
 
 
533 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1165  hypothetical protein  26.39 
 
 
531 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3720  hypothetical protein  25.92 
 
 
540 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1772  nitroreductase  26.27 
 
 
536 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  36.17 
 
 
382 aa  104  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  25.23 
 
 
502 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  32.07 
 
 
221 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  24.5 
 
 
526 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  34.78 
 
 
202 aa  99  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  33.33 
 
 
239 aa  98.2  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  23.25 
 
 
513 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  23.18 
 
 
514 aa  97.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  23.59 
 
 
513 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  23.73 
 
 
491 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  34.24 
 
 
207 aa  96.7  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  24.02 
 
 
520 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  23.45 
 
 
513 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  23.45 
 
 
513 aa  95.9  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  23.45 
 
 
513 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  34.18 
 
 
234 aa  94.7  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4206  nitroreductase  25.7 
 
 
531 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  35.48 
 
 
246 aa  94.7  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  24.07 
 
 
556 aa  94  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  23.25 
 
 
513 aa  93.2  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  25.28 
 
 
532 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  35.05 
 
 
235 aa  93.2  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  24.03 
 
 
546 aa  91.3  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  34.74 
 
 
248 aa  90.1  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  33.33 
 
 
274 aa  90.1  9e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  23.34 
 
 
513 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  23.39 
 
 
513 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  28.22 
 
 
214 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  31.35 
 
 
242 aa  87.8  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  31.12 
 
 
250 aa  85.5  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  36.25 
 
 
242 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  33.15 
 
 
255 aa  84.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  30 
 
 
558 aa  84.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  31.87 
 
 
246 aa  84  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  34.52 
 
 
559 aa  84  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  29.57 
 
 
547 aa  83.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  29.86 
 
 
564 aa  83.2  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  28.24 
 
 
236 aa  83.2  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  30.49 
 
 
251 aa  83.2  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  36.15 
 
 
259 aa  82  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  29.22 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  33.16 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.5 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  31.55 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  30.89 
 
 
257 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  30.38 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  32.65 
 
 
253 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  31.89 
 
 
254 aa  75.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  28.72 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  28.73 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  31.77 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  31.17 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  28.04 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.55 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  29.81 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  31.69 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  31.58 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  28.89 
 
 
529 aa  70.1  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.17 
 
 
391 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  26.83 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  29.17 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  28.4 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  28.19 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  26.34 
 
 
205 aa  66.6  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  26.88 
 
 
205 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.29 
 
 
341 aa  65.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  34.31 
 
 
473 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  25.54 
 
 
354 aa  64.7  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  30.81 
 
 
256 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  27.98 
 
 
252 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  28.97 
 
 
252 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  26.58 
 
 
602 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  32.67 
 
 
203 aa  61.6  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  25.51 
 
 
257 aa  62  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  30.83 
 
 
357 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3691  hypothetical protein  25.73 
 
 
551 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392558  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2434  hypothetical protein  28.04 
 
 
538 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210466  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  24.73 
 
 
1514 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  26.43 
 
 
266 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  26.44 
 
 
229 aa  57.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  30.66 
 
 
474 aa  57  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>