74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1109 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  86.49 
 
 
222 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  69.4 
 
 
305 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  70.48 
 
 
262 aa  325  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  73.71 
 
 
217 aa  322  3e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  73.71 
 
 
217 aa  322  3e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  73.71 
 
 
217 aa  322  3e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  73.71 
 
 
217 aa  322  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  73.71 
 
 
217 aa  322  3e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  71.09 
 
 
221 aa  321  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  72.04 
 
 
221 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  72.77 
 
 
217 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  61.97 
 
 
217 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  61.97 
 
 
217 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  55.71 
 
 
222 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  55.11 
 
 
232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  50.74 
 
 
228 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  54.74 
 
 
223 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  51.23 
 
 
219 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  48.66 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  47.15 
 
 
284 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  46.84 
 
 
218 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  45.03 
 
 
282 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  44.21 
 
 
217 aa  153  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  43.81 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  39.77 
 
 
218 aa  119  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  35.68 
 
 
193 aa  115  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  34.04 
 
 
202 aa  115  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  36.49 
 
 
235 aa  100  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  33.8 
 
 
274 aa  97.1  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  33.49 
 
 
234 aa  97.1  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  32.66 
 
 
205 aa  94  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  33.66 
 
 
237 aa  94  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  32.79 
 
 
189 aa  88.6  8e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  28.72 
 
 
221 aa  88.6  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  31.66 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  34.54 
 
 
202 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  29.15 
 
 
207 aa  79  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  34.48 
 
 
382 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.98 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  26.37 
 
 
250 aa  72  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  33.17 
 
 
239 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  32.14 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  26.57 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  30.58 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  31.55 
 
 
249 aa  65.1  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  28.22 
 
 
253 aa  62  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  30.33 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  29.85 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  29.41 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  30.86 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  29.3 
 
 
254 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  22.87 
 
 
371 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  26.44 
 
 
357 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  37.14 
 
 
242 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  33.08 
 
 
203 aa  53.5  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  28.43 
 
 
246 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  29.21 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  24.68 
 
 
246 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  28.85 
 
 
257 aa  50.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  26.88 
 
 
252 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  24.31 
 
 
3002 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  29.47 
 
 
252 aa  48.5  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  30.11 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  30.57 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  37.76 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  23.83 
 
 
3021 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  25.93 
 
 
243 aa  45.8  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  27.03 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  27.68 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  26.94 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  28.04 
 
 
375 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  29.38 
 
 
363 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  32.54 
 
 
458 aa  42  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>