168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4625 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  100 
 
 		 382 aa  770    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  39.29 
 
 		 251 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  44.91 
 
 		 246 aa  165  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  45.54 
 
 		 242 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  41.31 
 
 		 252 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  37.8 
 
 		 246 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  43.78 
 
 		 248 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  42.33 
 
 		 253 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  43.12 
 
 		 251 aa  151  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  41.92 
 
 		 202 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  38.22 
 
 		 257 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  42.79 
 
 		 259 aa  146  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  42.51 
 
 		 274 aa  144  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  40.67 
 
 		 214 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  37.88 
 
 		 221 aa  142  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  40.67 
 
 		 234 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  41.01 
 
 		 257 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  39.05 
 
 		 244 aa  138  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  42.03 
 
 		 235 aa  135  8e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  32.86 
 
 		 236 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  39.17 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  37.16 
 
 		 253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  35.51 
 
 		 259 aa  132  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  33.03 
 
 		 371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  40.74 
 
 		 256 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  41.01 
 
 		 252 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  40.29 
 
 		 237 aa  130  3e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  37.39 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  36.54 
 
 		 250 aa  130  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  35.04 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  40.09 
 
 		 252 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  38.29 
 
 		 249 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  36.18 
 
 		 207 aa  125  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  40 
 
 		 225 aa  123  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  35.61 
 
 		 242 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  35.87 
 
 		 255 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  35.47 
 
 		 207 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  38.54 
 
 		 239 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  32.88 
 
 		 375 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  36.68 
 
 		 205 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  39.36 
 
 		 508 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  39.36 
 
 		 508 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  33.49 
 
 		 251 aa  106  9e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  38.17 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  36.17 
 
 		 510 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  33.17 
 
 		 205 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  36.36 
 
 		 510 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  33.51 
 
 		 189 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  37.43 
 
 		 509 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  37.06 
 
 		 203 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  30.28 
 
 		 356 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  34.08 
 
 		 523 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  30.59 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  31.67 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  32 
 
 		 473 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  31.53 
 
 		 266 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  33.65 
 
 		 492 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  36.18 
 
 		 491 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  29.06 
 
 		 475 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  29.63 
 
 		 392 aa  87.4  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  30.66 
 
 		 458 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  29.15 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  36.09 
 
 		 518 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  27.23 
 
 		 474 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  31.39 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  34.52 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.94 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  31.38 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  29.67 
 
 		 202 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.96 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  35.82 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  36.03 
 
 		 526 aa  77  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  30.58 
 
 		 546 aa  76.6  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.77 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  27.23 
 
 		 547 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  34.48 
 
 		 249 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  31.14 
 
 		 538 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  31.14 
 
 		 551 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  27.72 
 
 		 3021 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0645  hypothetical protein  33.86 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  32.83 
 
 		 217 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  32.83 
 
 		 262 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  32.83 
 
 		 217 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  32.83 
 
 		 217 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  32.83 
 
 		 217 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  32.83 
 
 		 217 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  32.83 
 
 		 217 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0920  hypothetical protein  31.02 
 
 		 240 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2541  hypothetical protein  27.84 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0273286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  33.53 
 
 		 247 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2736  hypothetical protein  27.84 
 
 		 325 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.78205e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2726  hypothetical protein  28.87 
 
 		 300 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  32.83 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2553  hypothetical protein  26.8 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  hitchhiker  0.0000000044081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  32.61 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  33.54 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  29.52 
 
 		 513 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  29.94 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  28.37 
 
 		 491 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>