83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2359 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  100 
 
 
475 aa  981    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  46.23 
 
 
473 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  43.74 
 
 
471 aa  324  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  37.95 
 
 
474 aa  300  4e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  39.2 
 
 
458 aa  243  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  37.28 
 
 
491 aa  233  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  33.85 
 
 
461 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  37.67 
 
 
492 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  30.2 
 
 
250 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  28.46 
 
 
246 aa  92.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  29.06 
 
 
382 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  29.63 
 
 
252 aa  86.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  28.37 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  27.75 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  29.74 
 
 
214 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  30.59 
 
 
371 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  28.25 
 
 
251 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  30.58 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  31.5 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  31.4 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  26.27 
 
 
249 aa  75.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  25 
 
 
255 aa  75.5  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  30.18 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  27.78 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  28.38 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  27.19 
 
 
252 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  30.96 
 
 
235 aa  72  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  27.67 
 
 
221 aa  71.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  24.23 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  31.44 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  27.6 
 
 
356 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  30.56 
 
 
234 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  27.1 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  27.16 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  25.76 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  25.45 
 
 
255 aa  64.3  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  28.96 
 
 
257 aa  63.5  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  31.61 
 
 
508 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  31.61 
 
 
508 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  27.89 
 
 
242 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  27.6 
 
 
252 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  26.32 
 
 
251 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  29.35 
 
 
239 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  28.3 
 
 
392 aa  61.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  27.03 
 
 
256 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  32.31 
 
 
236 aa  59.3  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  24.47 
 
 
203 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.35 
 
 
391 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  28.43 
 
 
259 aa  57.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  30.11 
 
 
237 aa  57  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  25.12 
 
 
207 aa  54.7  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  25.37 
 
 
202 aa  54.3  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  31.67 
 
 
222 aa  53.9  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  25.79 
 
 
205 aa  53.5  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  29.05 
 
 
510 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  27.75 
 
 
189 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2589  hypothetical protein  26.89 
 
 
537 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0423242  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  27.03 
 
 
523 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  24.39 
 
 
363 aa  50.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  24.86 
 
 
228 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  32.67 
 
 
2454 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  26.7 
 
 
503 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  26.56 
 
 
205 aa  47.4  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  30.17 
 
 
510 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4206  nitroreductase  26.05 
 
 
531 aa  46.6  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  25.55 
 
 
252 aa  46.6  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  24.02 
 
 
202 aa  46.6  0.0009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  23.85 
 
 
251 aa  47  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2553  hypothetical protein  21.72 
 
 
325 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  hitchhiker  0.0000000044081 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  27.65 
 
 
266 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  26.7 
 
 
219 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3691  hypothetical protein  26.79 
 
 
551 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392558  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  30.08 
 
 
222 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2434  hypothetical protein  23.39 
 
 
538 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210466  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  29.41 
 
 
3002 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0919  hypothetical protein  26.96 
 
 
610 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  29.31 
 
 
509 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  23.87 
 
 
3739 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  23.2 
 
 
518 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  23.84 
 
 
530 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  26.11 
 
 
526 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  23.2 
 
 
207 aa  43.9  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  25.74 
 
 
250 aa  43.5  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>