87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3966 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  85.98 
 
 		 492 aa  806    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  973    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  37.28 
 
 		 475 aa  233  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  41.24 
 
 		 474 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  39.06 
 
 		 471 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  40.14 
 
 		 458 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  36.76 
 
 		 473 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  36.02 
 
 		 461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  32.27 
 
 		 392 aa  91.3  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  32.39 
 
 		 259 aa  90.5  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  36.18 
 
 		 382 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  31.84 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  34.13 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  30.11 
 
 		 250 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  27.09 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.18 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  29.09 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  29.56 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  30.09 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  29.17 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  29.33 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  31.87 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  34.54 
 
 		 234 aa  69.7  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  33.15 
 
 		 214 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  31.37 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  30.3 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  31.09 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  28.7 
 
 		 248 aa  67  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  26.41 
 
 		 252 aa  67  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  35.67 
 
 		 252 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  31.28 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  32.11 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  30.77 
 
 		 255 aa  65.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  28.8 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  28.18 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  30.9 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2553  hypothetical protein  19.12 
 
 		 325 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  hitchhiker  0.0000000044081 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  28.12 
 
 		 207 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  29.91 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  32.26 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  32.56 
 
 		 254 aa  62  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  32.69 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  33.33 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2736  hypothetical protein  19.12 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.78205e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2541  hypothetical protein  19.12 
 
 		 329 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0273286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2726  hypothetical protein  19.12 
 
 		 300 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  32.61 
 
 		 252 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  30.93 
 
 		 239 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  26.18 
 
 		 246 aa  57  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  33.14 
 
 		 202 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  32.34 
 
 		 363 aa  55.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  30.46 
 
 		 256 aa  54.3  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  32.06 
 
 		 236 aa  52  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  28.81 
 
 		 229 aa  52  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  30.6 
 
 		 237 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  24.86 
 
 		 3021 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3674  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 		 860 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  33.04 
 
 		 513 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  33.04 
 
 		 513 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  33.04 
 
 		 513 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  33.04 
 
 		 491 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  33.04 
 
 		 513 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  31.16 
 
 		 250 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  27.75 
 
 		 189 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  33.93 
 
 		 513 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  33.04 
 
 		 513 aa  48.5  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0645  hypothetical protein  30.16 
 
 		 152 aa  48.5  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  28.8 
 
 		 205 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  29.29 
 
 		 518 aa  48.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  33.04 
 
 		 520 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  24.88 
 
 		 526 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  28.95 
 
 		 518 aa  47.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3720  hypothetical protein  24.81 
 
 		 540 aa  47  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  26.88 
 
 		 205 aa  47  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  31.03 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  26.29 
 
 		 3002 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  23.16 
 
 		 1514 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  29.75 
 
 		 523 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3945  hypothetical protein  31.46 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0479721 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  27.33 
 
 		 203 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  26.11 
 
 		 266 aa  46.2  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  32.43 
 
 		 513 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  33.04 
 
 		 513 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  28.02 
 
 		 529 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  28.04 
 
 		 242 aa  43.9  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  24.89 
 
 		 559 aa  43.5  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  28.46 
 
 		 2706 aa  43.5  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>