132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1974 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  526  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  51.04 
 
 
251 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  49.38 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  49.17 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  48.97 
 
 
259 aa  229  4e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  46.12 
 
 
248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  44.26 
 
 
251 aa  219  5e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  44.44 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  41.41 
 
 
257 aa  186  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  42.73 
 
 
249 aa  186  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  42.29 
 
 
255 aa  185  7e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  40.97 
 
 
254 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  44.44 
 
 
252 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  41.18 
 
 
256 aa  176  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  40 
 
 
255 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  37.87 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  38.59 
 
 
251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  39.56 
 
 
252 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  44.06 
 
 
246 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  45.3 
 
 
203 aa  170  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  37.34 
 
 
257 aa  168  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  39.56 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  41.31 
 
 
382 aa  158  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  36.71 
 
 
221 aa  139  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  37 
 
 
244 aa  139  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  35.48 
 
 
250 aa  132  6e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  38.29 
 
 
242 aa  128  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  33.65 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  35.98 
 
 
202 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  32.09 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  33.97 
 
 
234 aa  108  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  32.51 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  34.25 
 
 
214 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  33.5 
 
 
207 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  31.6 
 
 
274 aa  105  8e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  31.94 
 
 
235 aa  104  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  30.4 
 
 
371 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  30.77 
 
 
237 aa  100  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.69 
 
 
207 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  29.25 
 
 
523 aa  92.8  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  29.63 
 
 
475 aa  86.3  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  28.8 
 
 
189 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  29.58 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.76 
 
 
391 aa  82.4  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  28.57 
 
 
205 aa  82  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  28.7 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  34.03 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  30.1 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  26.75 
 
 
356 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  25.68 
 
 
474 aa  79  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.8 
 
 
461 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  28.57 
 
 
509 aa  77.4  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  30.38 
 
 
510 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  28.8 
 
 
508 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  28.8 
 
 
508 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  26.46 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.61 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  26.44 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  29.7 
 
 
503 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  24.32 
 
 
357 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  27.75 
 
 
354 aa  72.4  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  29.85 
 
 
218 aa  72  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  25.53 
 
 
510 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  25.34 
 
 
458 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  28.24 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  25.14 
 
 
1514 aa  67  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  26.2 
 
 
492 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  26.41 
 
 
491 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  29.63 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  28.57 
 
 
518 aa  65.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  27.67 
 
 
518 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2541  hypothetical protein  22.06 
 
 
329 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0273286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2726  hypothetical protein  22.06 
 
 
300 aa  62  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  21.63 
 
 
471 aa  62  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  25.52 
 
 
656 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2736  hypothetical protein  22.55 
 
 
325 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.78205e-21 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  27.8 
 
 
222 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2553  hypothetical protein  22.06 
 
 
325 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  hitchhiker  0.0000000044081 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  26.02 
 
 
3021 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  23.4 
 
 
218 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  29.63 
 
 
564 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  25.53 
 
 
551 aa  58.5  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  24.3 
 
 
247 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  25.53 
 
 
538 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  26.92 
 
 
175 aa  57.8  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  28.23 
 
 
217 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  24.86 
 
 
547 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  30.86 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  26.05 
 
 
217 aa  56.2  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  32.1 
 
 
228 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  24.85 
 
 
3002 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  27.27 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  22.41 
 
 
556 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  24.82 
 
 
529 aa  54.3  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  21.76 
 
 
530 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  25.13 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  26.29 
 
 
2454 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  22.38 
 
 
229 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  31.25 
 
 
232 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  29.26 
 
 
282 aa  52.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>