109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0348 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  100 
 
 
229 aa  452  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  79.48 
 
 
229 aa  371  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  34.48 
 
 
242 aa  95.1  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  39.71 
 
 
244 aa  89.7  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  30.49 
 
 
221 aa  89  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  29.44 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  33.97 
 
 
214 aa  86.3  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  38.37 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  34.52 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  31.36 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  23.92 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  32.21 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  33.56 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  32.2 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  32.35 
 
 
246 aa  74.7  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  37.57 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  30.56 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  34.46 
 
 
239 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  29.37 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  30.06 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  31.16 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  32.41 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  34.3 
 
 
235 aa  67  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.78 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  30.61 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  33.08 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  34.33 
 
 
564 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  35.51 
 
 
529 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  30.56 
 
 
257 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  31.25 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  30.97 
 
 
532 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  33.09 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0919  hypothetical protein  30.71 
 
 
610 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  29.92 
 
 
656 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  31.5 
 
 
551 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  31.5 
 
 
538 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  30.43 
 
 
547 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  32.61 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  28.37 
 
 
523 aa  59.3  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  31.43 
 
 
509 aa  59.3  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  28.09 
 
 
510 aa  58.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  32.87 
 
 
503 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  31.34 
 
 
546 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  31.82 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  26.92 
 
 
508 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  26.92 
 
 
508 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  25.58 
 
 
514 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  29.86 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  28.95 
 
 
184 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  24.89 
 
 
513 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  25.38 
 
 
510 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  25.88 
 
 
513 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  25.88 
 
 
513 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  22.38 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  30.34 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  25.93 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  25.88 
 
 
513 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  29.58 
 
 
375 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  25.88 
 
 
513 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  26.69 
 
 
513 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  29.46 
 
 
502 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  25.53 
 
 
513 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  29.17 
 
 
252 aa  52.4  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  28.78 
 
 
266 aa  52.4  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2736  hypothetical protein  22.08 
 
 
325 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.78205e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2726  hypothetical protein  22.08 
 
 
300 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2541  hypothetical protein  22.08 
 
 
329 aa  52  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0273286  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  28.81 
 
 
491 aa  52  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  29.86 
 
 
602 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  28.78 
 
 
526 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  25.73 
 
 
356 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  27.56 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  27.12 
 
 
491 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  28.57 
 
 
556 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  27.07 
 
 
255 aa  49.3  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  24.34 
 
 
513 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  50 
 
 
474 aa  48.9  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  24.12 
 
 
205 aa  48.9  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  31.08 
 
 
558 aa  48.5  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  28.26 
 
 
252 aa  48.5  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  28.17 
 
 
354 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  24.78 
 
 
188 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  24.86 
 
 
195 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  27.27 
 
 
205 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  35.63 
 
 
175 aa  46.6  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  36 
 
 
175 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  34.21 
 
 
174 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0645  hypothetical protein  28.7 
 
 
152 aa  45.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  36.49 
 
 
192 aa  45.4  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  26.57 
 
 
189 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2553  hypothetical protein  20.35 
 
 
325 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  hitchhiker  0.0000000044081 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  25.71 
 
 
371 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.06 
 
 
391 aa  45.1  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  29.59 
 
 
203 aa  45.4  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  25 
 
 
341 aa  45.1  0.0009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4206  nitroreductase  28.24 
 
 
531 aa  45.1  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  27.59 
 
 
357 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  24.43 
 
 
533 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  27.78 
 
 
518 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  27.45 
 
 
392 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>