156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0780 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  100 
 
 
244 aa  500  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  42.74 
 
 
242 aa  164  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  41.87 
 
 
246 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  40.58 
 
 
259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  39.05 
 
 
382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  36.76 
 
 
251 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  37 
 
 
252 aa  145  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  42.11 
 
 
253 aa  145  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  35.2 
 
 
248 aa  142  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  38.57 
 
 
251 aa  139  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  42.44 
 
 
274 aa  138  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  38.05 
 
 
255 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  37.61 
 
 
254 aa  135  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  39.15 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  37.12 
 
 
249 aa  133  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  37.5 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  38.19 
 
 
207 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  40.98 
 
 
234 aa  131  9e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  34.31 
 
 
257 aa  131  9e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  33.91 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  33.2 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  35.47 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  39.71 
 
 
237 aa  128  9.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  38.5 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  37.67 
 
 
242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  39.49 
 
 
202 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  34.15 
 
 
250 aa  122  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  38.86 
 
 
252 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  38.14 
 
 
252 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  37.82 
 
 
256 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  40 
 
 
235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  38.99 
 
 
239 aa  118  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  33.8 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  41.5 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  36.5 
 
 
214 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  34.27 
 
 
259 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  29.2 
 
 
251 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  31.22 
 
 
205 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  30.52 
 
 
371 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  31.19 
 
 
205 aa  102  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  32.18 
 
 
189 aa  102  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.97 
 
 
207 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  33.69 
 
 
508 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  33.69 
 
 
508 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  39.71 
 
 
229 aa  90.1  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  31.39 
 
 
375 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  29.73 
 
 
203 aa  89  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  29.7 
 
 
509 aa  88.6  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  32.64 
 
 
503 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  28.71 
 
 
510 aa  86.7  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  37.87 
 
 
518 aa  87  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  26.75 
 
 
523 aa  85.1  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  28.93 
 
 
510 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  30.81 
 
 
266 aa  78.6  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  31.07 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.48 
 
 
391 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  28.64 
 
 
514 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  29.84 
 
 
356 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  30.59 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  30.81 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  31.11 
 
 
229 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  30.37 
 
 
526 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  34.12 
 
 
556 aa  69.7  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  31.95 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  35.56 
 
 
529 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  35.03 
 
 
547 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  36.5 
 
 
564 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
656 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  32.31 
 
 
363 aa  65.1  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  32.34 
 
 
284 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  31.38 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  28.85 
 
 
474 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3945  hypothetical protein  29.89 
 
 
428 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0479721 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  33.58 
 
 
431 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  25.47 
 
 
357 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  27.42 
 
 
458 aa  62.4  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  29.06 
 
 
513 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  34.07 
 
 
532 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.29 
 
 
174 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  28.43 
 
 
3002 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.05 
 
 
530 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  29.25 
 
 
513 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  26.67 
 
 
533 aa  59.3  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  32.91 
 
 
538 aa  58.9  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  32.91 
 
 
551 aa  59.3  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  25.52 
 
 
341 aa  58.5  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  31.55 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12860  hypothetical protein  30 
 
 
531 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.742525 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0857  nitroreductase  40.51 
 
 
175 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  32.51 
 
 
282 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  26.74 
 
 
513 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  26.74 
 
 
513 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  26.74 
 
 
513 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  26.74 
 
 
513 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  26.42 
 
 
491 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  26.74 
 
 
513 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  32.74 
 
 
559 aa  55.8  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  31.86 
 
 
219 aa  55.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  29.5 
 
 
546 aa  55.8  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  24.62 
 
 
473 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>