104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0770 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  100 
 
 
217 aa  452  1.0000000000000001e-126  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  46.88 
 
 
218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  47.87 
 
 
247 aa  178  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  46.49 
 
 
284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  44.88 
 
 
282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  44.21 
 
 
249 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  44.27 
 
 
219 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  45.41 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  38.97 
 
 
254 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  44.15 
 
 
262 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  44.15 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  44.15 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  44.15 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  44.15 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  44.15 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  44.15 
 
 
305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  44.62 
 
 
232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  44.92 
 
 
217 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  38.1 
 
 
218 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  43.48 
 
 
221 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  42.55 
 
 
221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  43.09 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  43.09 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  40.54 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  40.41 
 
 
228 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  41.4 
 
 
223 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  34.85 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  36.7 
 
 
202 aa  119  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  32.02 
 
 
234 aa  95.5  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  32.66 
 
 
242 aa  92.8  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  31.55 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  31.37 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  29.46 
 
 
274 aa  89.7  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  28.7 
 
 
221 aa  90.1  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  31.07 
 
 
205 aa  88.6  6e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  31.19 
 
 
207 aa  85.9  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  31.4 
 
 
250 aa  85.5  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  29.13 
 
 
205 aa  82  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  31.79 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  31.38 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  28.36 
 
 
225 aa  74.7  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  30.15 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.65 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  29.94 
 
 
382 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  29.65 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  32.39 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  29.32 
 
 
255 aa  67  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.81 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  29.94 
 
 
257 aa  65.1  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  33.33 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  29.11 
 
 
257 aa  62.8  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  28.44 
 
 
363 aa  62  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  25 
 
 
371 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  28.49 
 
 
254 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  29.21 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  28.12 
 
 
356 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  22.86 
 
 
174 aa  58.2  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  26.24 
 
 
251 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  28.66 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  26.05 
 
 
252 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  27.06 
 
 
252 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  37.76 
 
 
242 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  27.36 
 
 
246 aa  52.8  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0371  nitroreductase  24.87 
 
 
261 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  23.84 
 
 
183 aa  52.4  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  26.9 
 
 
255 aa  52.4  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  27.45 
 
 
248 aa  52  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  26.32 
 
 
251 aa  52  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  24.16 
 
 
168 aa  52  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  24.86 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  26.14 
 
 
186 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0202  nitroreductase  24.74 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.779167  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.4 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  25.86 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  24.88 
 
 
246 aa  50.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  24.87 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  31.98 
 
 
252 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  26.83 
 
 
204 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  28.69 
 
 
474 aa  48.5  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  27.07 
 
 
184 aa  48.5  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  24.71 
 
 
181 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  30.77 
 
 
250 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  31.06 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  25.29 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.84 
 
 
391 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  25.99 
 
 
163 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3602  nitroreductase  25.13 
 
 
246 aa  46.2  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.263517  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  22.8 
 
 
357 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  22.7 
 
 
172 aa  45.1  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  23.78 
 
 
246 aa  45.1  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  31.31 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  25.24 
 
 
259 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4035  nitroreductase  26.26 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  25.47 
 
 
174 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  23.24 
 
 
508 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  25.29 
 
 
375 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  23.24 
 
 
508 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  25 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3889  nitroreductase  23.03 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  26.13 
 
 
471 aa  42.4  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>