68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0553 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  908    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  48.96 
 
 		 461 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  39.2 
 
 		 475 aa  243  7e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  41.18 
 
 		 471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  40.14 
 
 		 491 aa  213  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  38.67 
 
 		 473 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  38.89 
 
 		 474 aa  199  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  37.9 
 
 		 492 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  30.29 
 
 		 392 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  31.98 
 
 		 259 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  27.78 
 
 		 246 aa  87  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  30.66 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  28.89 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  37.04 
 
 		 235 aa  75.9  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  28.82 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  26.92 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  24.45 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  25.43 
 
 		 248 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  31.96 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  32.49 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  25.34 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  29.6 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  27.75 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  30.17 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  32.39 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  25.34 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  31.03 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  25.26 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  27.75 
 
 		 252 aa  67  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  29.77 
 
 		 255 aa  67  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  30.39 
 
 		 357 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  29.65 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  25.48 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  27.96 
 
 		 254 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  35.06 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  27.67 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  27.57 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  27.27 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  27.23 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  28.86 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  30.17 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  31.07 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  34.23 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  27.45 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  29.23 
 
 		 242 aa  57  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  27.27 
 
 		 256 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  28.11 
 
 		 252 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  25.74 
 
 		 221 aa  54.3  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.42 
 
 		 244 aa  53.9  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  29.79 
 
 		 237 aa  53.9  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  26.79 
 
 		 242 aa  53.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  29.27 
 
 		 202 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  25.76 
 
 		 266 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  27.88 
 
 		 510 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  27.15 
 
 		 203 aa  50.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2553  hypothetical protein  20.37 
 
 		 325 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  hitchhiker  0.0000000044081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  24.22 
 
 		 547 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2589  hypothetical protein  28.72 
 
 		 537 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0423242  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2736  hypothetical protein  21.97 
 
 		 325 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.78205e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2726  hypothetical protein  21.97 
 
 		 300 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2434  hypothetical protein  25.94 
 
 		 538 aa  47.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210466  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2541  hypothetical protein  21.97 
 
 		 329 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0273286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  28.04 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  26.99 
 
 		 207 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0919  hypothetical protein  26.67 
 
 		 610 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3691  hypothetical protein  30.08 
 
 		 551 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4206  nitroreductase  26.32 
 
 		 531 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  24.44 
 
 		 341 aa  43.1  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>