75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0382 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  55.66 
 
 		 222 aa  219  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  51.23 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  54.46 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  54.46 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  50.76 
 
 		 305 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  50.76 
 
 		 217 aa  194  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  50.76 
 
 		 217 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  50.76 
 
 		 217 aa  194  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  50.76 
 
 		 217 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  50.76 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  50.76 
 
 		 217 aa  194  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  50.25 
 
 		 222 aa  194  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  52.31 
 
 		 221 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  53.26 
 
 		 217 aa  191  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  52.38 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  50.76 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  50.72 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  52.94 
 
 		 218 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  52.82 
 
 		 282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  50.5 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  51.63 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  49.06 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  44.32 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  45.3 
 
 		 254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  36.52 
 
 		 202 aa  122  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  40.31 
 
 		 193 aa  122  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  37.1 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  33.99 
 
 		 235 aa  92.4  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  33.18 
 
 		 274 aa  90.9  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  30.85 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  26.92 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  29.35 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  31.03 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  30.1 
 
 		 205 aa  81.3  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  28.88 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  31.61 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  32.79 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  26.13 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  29.03 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  30.48 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  31.98 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.9 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  28.49 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  32.67 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  28.97 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  25.27 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  29.72 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  28.57 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  26.09 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  27.96 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  28.09 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  27.22 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  26.42 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  25.29 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  26.57 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  29.9 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  28.89 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  27.51 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  26.83 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  28.5 
 
 		 259 aa  52  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  27.75 
 
 		 259 aa  51.6  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  26.7 
 
 		 475 aa  52  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  33.01 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  28.72 
 
 		 375 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  27.39 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  29.11 
 
 		 255 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  25.4 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  27.83 
 
 		 354 aa  46.6  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  21.24 
 
 		 371 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  30.05 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  26.67 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  25.14 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  26.46 
 
 		 508 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  26.46 
 
 		 508 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>