157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0678 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  100 
 
 		 242 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  45.54 
 
 		 382 aa  188  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  42.69 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  42.74 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  44.5 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  42.51 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  44.49 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  46.08 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  39.43 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  35.02 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  37.84 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  41.15 
 
 		 250 aa  148  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  38.46 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  39.39 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  34.33 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  40.47 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  40.55 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  41.3 
 
 		 221 aa  139  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  41.12 
 
 		 202 aa  138  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  43.96 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  41.92 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  38.07 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  40.21 
 
 		 257 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  32.58 
 
 		 371 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  42.08 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  42.08 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  38.71 
 
 		 255 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  42.57 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  37.67 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  39.46 
 
 		 254 aa  128  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  40.55 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  33.01 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  41.58 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  41.09 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  37.79 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  34.05 
 
 		 207 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  40 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  32.35 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  36.31 
 
 		 523 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  34.57 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  33.51 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  34.22 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  35.33 
 
 		 508 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  35.33 
 
 		 508 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  32.73 
 
 		 356 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  36.09 
 
 		 203 aa  102  7e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  34.92 
 
 		 510 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  34.88 
 
 		 189 aa  101  9e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  38.92 
 
 		 510 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  38.32 
 
 		 509 aa  99.4  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  34.33 
 
 		 503 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  31.28 
 
 		 375 aa  95.5  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.21 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  35.24 
 
 		 518 aa  94.4  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  31.36 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  27.7 
 
 		 357 aa  89  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  31.36 
 
 		 391 aa  85.9  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  27.89 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  33.91 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  32.88 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  31.48 
 
 		 513 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  31.48 
 
 		 513 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  29.39 
 
 		 526 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  30.43 
 
 		 491 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  29.95 
 
 		 513 aa  79  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  29.95 
 
 		 513 aa  79  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  29.95 
 
 		 513 aa  79  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  29.95 
 
 		 513 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  29.95 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  31.86 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  30.43 
 
 		 513 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  29.27 
 
 		 546 aa  78.2  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  27.75 
 
 		 514 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  31.12 
 
 		 530 aa  77  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  25.32 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  31.2 
 
 		 492 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  29.73 
 
 		 520 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  27.14 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  33.17 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  29.49 
 
 		 458 aa  72.4  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  30.41 
 
 		 473 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  32.22 
 
 		 3021 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  32.04 
 
 		 3002 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3945  hypothetical protein  33.33 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0479721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  29.5 
 
 		 564 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  28.42 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  27.23 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  29.84 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  29.44 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  30 
 
 		 538 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  30 
 
 		 551 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  27.59 
 
 		 533 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  26.38 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.86 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  29.83 
 
 		 559 aa  66.2  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  29.55 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  30.14 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  27.92 
 
 		 284 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  28.7 
 
 		 518 aa  65.1  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  32.41 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>