84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3274 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  100 
 
 
546 aa  1116    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  45.14 
 
 
656 aa  451  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  44.3 
 
 
538 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  44.57 
 
 
547 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  44.3 
 
 
551 aa  428  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  44.64 
 
 
556 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  46.41 
 
 
529 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  44.24 
 
 
532 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  43.04 
 
 
564 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  44.52 
 
 
558 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  41.3 
 
 
533 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  41.19 
 
 
559 aa  336  7.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3720  hypothetical protein  40.94 
 
 
540 aa  335  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1772  nitroreductase  41.67 
 
 
536 aa  332  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1165  hypothetical protein  38.7 
 
 
531 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12860  hypothetical protein  38.8 
 
 
531 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.742525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  40.09 
 
 
602 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  24.45 
 
 
431 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  23.41 
 
 
523 aa  107  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  25.04 
 
 
509 aa  106  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  25.71 
 
 
518 aa  104  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3945  hypothetical protein  23.2 
 
 
428 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0479721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  25.94 
 
 
503 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  23.74 
 
 
508 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  23.74 
 
 
508 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  24.03 
 
 
510 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  23.97 
 
 
530 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  23.33 
 
 
510 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  30.58 
 
 
382 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  31.52 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  29.6 
 
 
259 aa  69.7  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  31.4 
 
 
242 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  33.55 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  27.55 
 
 
237 aa  64.7  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  30.77 
 
 
253 aa  63.9  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  28.85 
 
 
491 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  27.81 
 
 
234 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  31.62 
 
 
207 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  27.96 
 
 
514 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  31.34 
 
 
356 aa  61.6  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  29.17 
 
 
246 aa  61.6  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  27.88 
 
 
513 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  27.88 
 
 
513 aa  60.1  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  27.88 
 
 
513 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  27.88 
 
 
513 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  27.88 
 
 
513 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  37.14 
 
 
391 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  26.58 
 
 
257 aa  58.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  27.54 
 
 
513 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  30.5 
 
 
392 aa  57.4  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  30.15 
 
 
251 aa  57.4  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  31.34 
 
 
229 aa  57.4  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  31.82 
 
 
214 aa  57  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  27.27 
 
 
513 aa  57  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  27.01 
 
 
259 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  33.87 
 
 
502 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  31.21 
 
 
248 aa  55.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  26.92 
 
 
513 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  26.98 
 
 
520 aa  54.7  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.37 
 
 
244 aa  54.7  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  33.33 
 
 
526 aa  54.7  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  24.85 
 
 
207 aa  53.5  0.000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.55 
 
 
229 aa  53.5  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  23.13 
 
 
221 aa  52.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  25 
 
 
251 aa  52  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  27.59 
 
 
225 aa  51.2  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  29.41 
 
 
252 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0919  hypothetical protein  27.15 
 
 
610 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  30.14 
 
 
242 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  25 
 
 
246 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  30.36 
 
 
252 aa  48.9  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  27.27 
 
 
202 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  27.38 
 
 
249 aa  48.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  28.89 
 
 
254 aa  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  30.81 
 
 
250 aa  47  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  25.64 
 
 
236 aa  46.6  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  26.67 
 
 
257 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  27.44 
 
 
252 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  27.34 
 
 
3002 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  28.57 
 
 
205 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  25.19 
 
 
251 aa  44.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  25.57 
 
 
357 aa  43.9  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  26.95 
 
 
239 aa  43.9  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  27.34 
 
 
252 aa  43.5  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>