109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0193 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  100 
 
 
392 aa  802    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.44 
 
 
391 aa  134  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  38.46 
 
 
266 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  28.53 
 
 
363 aa  108  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  30.13 
 
 
356 aa  103  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  30.29 
 
 
458 aa  95.5  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  26.96 
 
 
371 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  32.59 
 
 
257 aa  93.2  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  28.83 
 
 
236 aa  92.8  9e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  34.09 
 
 
253 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  31.55 
 
 
259 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  32.27 
 
 
491 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  31.94 
 
 
214 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  30.9 
 
 
492 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  29.63 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  32.19 
 
 
357 aa  87  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  31.75 
 
 
255 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  27.81 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  29.78 
 
 
248 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  33.69 
 
 
257 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  29.1 
 
 
246 aa  82  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  28.7 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  29.46 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  29.81 
 
 
259 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  26.8 
 
 
246 aa  78.6  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  33.33 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  31.84 
 
 
234 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  29.52 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  31.89 
 
 
255 aa  77  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  29.91 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  29.5 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  33.33 
 
 
547 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.09 
 
 
461 aa  73.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  27.27 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  24.8 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  31.29 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  32.19 
 
 
510 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  31.38 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  31.41 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  23.25 
 
 
473 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  29.1 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  33.33 
 
 
256 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  30.92 
 
 
551 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  26.78 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  30.92 
 
 
538 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  28.4 
 
 
510 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.91 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  29.1 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  33.93 
 
 
656 aa  67.4  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  30 
 
 
252 aa  67  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  32.26 
 
 
503 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0645  hypothetical protein  33.85 
 
 
152 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  31.68 
 
 
518 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  35.25 
 
 
529 aa  63.9  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  25.38 
 
 
471 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  30 
 
 
509 aa  62.8  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  25.54 
 
 
523 aa  63.2  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  31.63 
 
 
239 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  31.76 
 
 
508 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  35.11 
 
 
236 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  31.76 
 
 
508 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  28.3 
 
 
475 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  27.61 
 
 
474 aa  61.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  28.74 
 
 
526 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  31.13 
 
 
556 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  33.33 
 
 
189 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3691  hypothetical protein  27.53 
 
 
551 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392558  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  30.3 
 
 
242 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  29.12 
 
 
202 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  25.38 
 
 
250 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  25.13 
 
 
3021 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  25.13 
 
 
207 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  31.54 
 
 
205 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  30.5 
 
 
546 aa  57.4  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  28.29 
 
 
491 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  27.63 
 
 
513 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  28.48 
 
 
513 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  28.48 
 
 
513 aa  56.6  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  28.48 
 
 
513 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  28.48 
 
 
513 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  34 
 
 
564 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  29.51 
 
 
242 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4206  nitroreductase  27.15 
 
 
531 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  34.31 
 
 
559 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  27.22 
 
 
514 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12860  hypothetical protein  27.46 
 
 
531 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.742525 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2434  hypothetical protein  25 
 
 
538 aa  52.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210466  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  29.31 
 
 
251 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  27.69 
 
 
532 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  26.97 
 
 
513 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  27.92 
 
 
513 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  34.88 
 
 
602 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  28.57 
 
 
533 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  25.97 
 
 
520 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  27.92 
 
 
513 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  34.31 
 
 
558 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2589  hypothetical protein  23.73 
 
 
537 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0423242  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  26.98 
 
 
502 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  30.05 
 
 
250 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  28.18 
 
 
354 aa  49.7  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>