105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0997 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  100 
 
 
341 aa  684    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  31.1 
 
 
221 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  30.88 
 
 
382 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  30.29 
 
 
214 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  26.27 
 
 
251 aa  92  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  29.63 
 
 
202 aa  90.1  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  26.51 
 
 
257 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  27.8 
 
 
253 aa  88.2  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  25.97 
 
 
252 aa  87.8  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  26.61 
 
 
246 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  24.76 
 
 
255 aa  86.7  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  27.78 
 
 
257 aa  86.7  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  24.22 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  31.6 
 
 
205 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  27.59 
 
 
251 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  25 
 
 
255 aa  82.4  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  24.66 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  24.51 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  25.93 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  30.21 
 
 
205 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  27.88 
 
 
239 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  22.1 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  29.25 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  26.11 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  26.64 
 
 
246 aa  77  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  29.17 
 
 
189 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  24.17 
 
 
207 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  25.17 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  23.67 
 
 
251 aa  72  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  25.91 
 
 
242 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  33.83 
 
 
508 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  28.28 
 
 
1514 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  33.83 
 
 
508 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  25.77 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  27.04 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.91 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  30.99 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  28.21 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  21.61 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  24.66 
 
 
523 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  26.11 
 
 
518 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  22.13 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  27.01 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  27.4 
 
 
510 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  25.95 
 
 
250 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  27.8 
 
 
363 aa  65.1  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  26.26 
 
 
203 aa  64.3  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  32.33 
 
 
510 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  31.58 
 
 
509 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  26.8 
 
 
473 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  26.29 
 
 
375 aa  61.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  23.56 
 
 
244 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  26.94 
 
 
237 aa  59.3  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  27.87 
 
 
225 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  28.16 
 
 
266 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  29.73 
 
 
503 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  31.93 
 
 
3002 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  31.2 
 
 
3021 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  26.37 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  28.12 
 
 
235 aa  57  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2726  hypothetical protein  27.68 
 
 
300 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2541  hypothetical protein  27.68 
 
 
329 aa  56.6  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0273286  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2736  hypothetical protein  27.68 
 
 
325 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.78205e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2553  hypothetical protein  27.27 
 
 
325 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  hitchhiker  0.0000000044081 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  24.27 
 
 
203 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  26.02 
 
 
474 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  25.96 
 
 
221 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  27.57 
 
 
217 aa  55.8  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  24.88 
 
 
492 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  24.74 
 
 
458 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  26 
 
 
491 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  27.62 
 
 
3739 aa  53.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  22.76 
 
 
356 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  28.51 
 
 
249 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  27.96 
 
 
221 aa  53.1  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  25.81 
 
 
475 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  26.21 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  30.37 
 
 
217 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  30.37 
 
 
217 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3674  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 
860 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  25.49 
 
 
2454 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  24.02 
 
 
461 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  25.25 
 
 
262 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  25.94 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  28.57 
 
 
529 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  25.25 
 
 
217 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  23.35 
 
 
471 aa  47.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  25.25 
 
 
217 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  25.25 
 
 
217 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  25.25 
 
 
217 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  25.25 
 
 
217 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  25.25 
 
 
305 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2434  hypothetical protein  23.86 
 
 
538 aa  46.6  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210466  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  28.12 
 
 
236 aa  46.2  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  24.41 
 
 
217 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2589  hypothetical protein  23.3 
 
 
537 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0423242  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  25.56 
 
 
656 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  21.1 
 
 
392 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  23.03 
 
 
551 aa  45.1  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>