143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2630 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  100 
 
 		 257 aa  541  1e-153  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  48.51 
 
 		 253 aa  210  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  46.58 
 
 		 248 aa  209  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  45.92 
 
 		 246 aa  202  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  43.32 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  44.4 
 
 		 252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  43.97 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  41.63 
 
 		 251 aa  194  8.000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  44.64 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  42.24 
 
 		 251 aa  189  5e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  47.77 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  46.81 
 
 		 256 aa  186  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  47.21 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  44.83 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  43.72 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  40.89 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  39.3 
 
 		 249 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  40 
 
 		 255 aa  174  9e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  37.34 
 
 		 252 aa  168  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  42.42 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  34.84 
 
 		 246 aa  155  7e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  38.22 
 
 		 382 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  38.46 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  33.19 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  36.04 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  30.17 
 
 		 371 aa  115  6e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  34.16 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  36.65 
 
 		 239 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  34.57 
 
 		 221 aa  112  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  34.19 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  33.48 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  31.08 
 
 		 356 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  33.89 
 
 		 205 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  32.12 
 
 		 207 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  33.89 
 
 		 189 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  33.33 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.41 
 
 		 391 aa  99  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  31.16 
 
 		 202 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  32.74 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  35.12 
 
 		 207 aa  95.9  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  32.22 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  33.33 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  31.14 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  32.59 
 
 		 392 aa  93.2  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  33.01 
 
 		 375 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  31.84 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  31.84 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  27.7 
 
 		 474 aa  79  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  27.73 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  28.7 
 
 		 492 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  26.73 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.11 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  28.45 
 
 		 656 aa  73.2  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  25.24 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  27.75 
 
 		 547 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  30.17 
 
 		 458 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  30.58 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.78 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  24.62 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  25.7 
 
 		 471 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  30.3 
 
 		 508 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  30.3 
 
 		 508 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  32.91 
 
 		 503 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  29.85 
 
 		 529 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  26.18 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  28.96 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  28.14 
 
 		 473 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12860  hypothetical protein  27.08 
 
 		 531 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.742525 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  29.11 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  23.75 
 
 		 556 aa  62.4  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  29.38 
 
 		 551 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  29.38 
 
 		 538 aa  62.4  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1165  hypothetical protein  30.54 
 
 		 531 aa  62  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  31.36 
 
 		 202 aa  62  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  25.51 
 
 		 510 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  29.01 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.11 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  27.04 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  29.13 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  27.07 
 
 		 564 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  26.58 
 
 		 546 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  24.87 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  26.2 
 
 		 602 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  27.06 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  31.82 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  28.81 
 
 		 2454 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  30.22 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  27.22 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  24.86 
 
 		 559 aa  55.5  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  26.42 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  25.27 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  26.91 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  30.05 
 
 		 532 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  31.29 
 
 		 513 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  25.35 
 
 		 3739 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  26.51 
 
 		 305 aa  53.1  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  25.56 
 
 		 558 aa  52.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3720  hypothetical protein  28.02 
 
 		 540 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  27.54 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  27.07 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>