90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4677 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  100 
 
 		 492 aa  978    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  85.98 
 
 		 491 aa  841    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  37.67 
 
 		 475 aa  224  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  38.61 
 
 		 471 aa  217  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  40.4 
 
 		 474 aa  216  9e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  38.86 
 
 		 458 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  36.34 
 
 		 473 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  37.64 
 
 		 461 aa  173  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  33.49 
 
 		 382 aa  93.6  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  33.96 
 
 		 259 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  30.9 
 
 		 392 aa  92.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  36.19 
 
 		 259 aa  90.5  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  30.53 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  29.3 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  27.09 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  31.36 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  30.05 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  32.04 
 
 		 255 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  30.9 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  30.39 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  27.93 
 
 		 248 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  33.33 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  29.77 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  35.94 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  35.67 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  29.76 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  26.2 
 
 		 252 aa  69.7  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  29.49 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  28.18 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  34.11 
 
 		 252 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  32.06 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  30.74 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  33.33 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  29.28 
 
 		 225 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2553  hypothetical protein  19.61 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  hitchhiker  0.0000000044081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  31.85 
 
 		 357 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  32.11 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  28.28 
 
 		 207 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  27.83 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  33.55 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  33.86 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  33.33 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  29.69 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  29.47 
 
 		 253 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  31.36 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2736  hypothetical protein  19.12 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.78205e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2726  hypothetical protein  19.12 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2541  hypothetical protein  19.12 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0273286  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  33.59 
 
 		 236 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  29.91 
 
 		 256 aa  55.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  31.45 
 
 		 523 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  29.17 
 
 		 3021 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  32.26 
 
 		 237 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  28.1 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  30.06 
 
 		 510 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  27.04 
 
 		 529 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  27.81 
 
 		 205 aa  52  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  28.43 
 
 		 189 aa  50.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0645  hypothetical protein  36.26 
 
 		 152 aa  51.2  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  27.27 
 
 		 205 aa  50.4  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  32.66 
 
 		 250 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  30.71 
 
 		 518 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  31.43 
 
 		 229 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  29.11 
 
 		 559 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  28.31 
 
 		 3002 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  33.04 
 
 		 518 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  30.3 
 
 		 242 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  30.68 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  29.37 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.42 
 
 		 229 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.54 
 
 		 341 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  31.03 
 
 		 526 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3674  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 		 860 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3720  hypothetical protein  26.72 
 
 		 540 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  33.03 
 
 		 513 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  32.14 
 
 		 491 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  32.14 
 
 		 513 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  32.14 
 
 		 513 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  32.14 
 
 		 513 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  26.92 
 
 		 266 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  25.47 
 
 		 203 aa  45.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  33.04 
 
 		 513 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  32.14 
 
 		 513 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  24.06 
 
 		 251 aa  44.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  32.14 
 
 		 513 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  29.53 
 
 		 503 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  29.33 
 
 		 509 aa  43.9  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  28.87 
 
 		 284 aa  43.5  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>