56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0645 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0645  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  318  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  49.61 
 
 		 357 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  37.01 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  33.86 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  35.66 
 
 		 363 aa  68.6  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  33.85 
 
 		 392 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  29.23 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  31.97 
 
 		 356 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  32 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  29.03 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  31.71 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  26.56 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  26.36 
 
 		 202 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  26.56 
 
 		 205 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  27.78 
 
 		 242 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  33.04 
 
 		 250 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  27.78 
 
 		 266 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  30.25 
 
 		 236 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  25.6 
 
 		 246 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  25.78 
 
 		 251 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  30.16 
 
 		 491 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  27.05 
 
 		 239 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.84 
 
 		 244 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  28 
 
 		 248 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  27.78 
 
 		 252 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  24.22 
 
 		 205 aa  47.4  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  25.83 
 
 		 274 aa  47  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  29.27 
 
 		 508 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  28.91 
 
 		 255 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  29.27 
 
 		 508 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  26.72 
 
 		 234 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  28.7 
 
 		 229 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  29.46 
 
 		 254 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  32.54 
 
 		 503 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  29.01 
 
 		 257 aa  45.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  28.03 
 
 		 256 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  29.27 
 
 		 510 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.91 
 
 		 391 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  28.24 
 
 		 255 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0919  hypothetical protein  26.45 
 
 		 610 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  34.83 
 
 		 492 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  23.81 
 
 		 207 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  39.08 
 
 		 474 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  24.55 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  24.39 
 
 		 236 aa  43.5  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  25.4 
 
 		 252 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  33.06 
 
 		 526 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  29.91 
 
 		 514 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  26.67 
 
 		 237 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  22.73 
 
 		 250 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  26.32 
 
 		 257 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  25.22 
 
 		 207 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  26.4 
 
 		 253 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  28.21 
 
 		 513 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  31.4 
 
 		 491 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  27.13 
 
 		 253 aa  40.4  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>