84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0354 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  61.79 
 
 
513 aa  676    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1310  hypothetical protein  61.33 
 
 
513 aa  677    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  61.03 
 
 
513 aa  676    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  100 
 
 
526 aa  1091    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  61.6 
 
 
513 aa  681    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  61.6 
 
 
513 aa  681    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  60.53 
 
 
514 aa  676    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1162  hypothetical protein  62.36 
 
 
520 aa  697    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  60.84 
 
 
513 aa  677    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  61.41 
 
 
513 aa  681    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  61.6 
 
 
513 aa  681    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  60.44 
 
 
491 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2434  hypothetical protein  27.68 
 
 
538 aa  131  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210466  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2589  hypothetical protein  26.88 
 
 
537 aa  123  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0423242  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  25.24 
 
 
530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3691  hypothetical protein  24.94 
 
 
551 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392558  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  28.08 
 
 
518 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  24.9 
 
 
523 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4206  nitroreductase  24.49 
 
 
531 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  24.5 
 
 
510 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  23.54 
 
 
510 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  25.26 
 
 
508 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  25.26 
 
 
508 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  23.47 
 
 
509 aa  92.8  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  22.24 
 
 
503 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  36.03 
 
 
382 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  28.77 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.86 
 
 
244 aa  70.1  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  29.03 
 
 
235 aa  64.7  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  31.94 
 
 
431 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  30.54 
 
 
214 aa  62.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  31.11 
 
 
259 aa  62.4  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  28.74 
 
 
392 aa  61.2  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  26.56 
 
 
274 aa  60.5  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  30.37 
 
 
202 aa  60.5  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  27.51 
 
 
234 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3945  hypothetical protein  27.75 
 
 
428 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0479721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  27.43 
 
 
558 aa  57.8  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  25.57 
 
 
254 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  24.87 
 
 
239 aa  54.7  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  25.14 
 
 
242 aa  54.7  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  26.82 
 
 
371 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  33.33 
 
 
546 aa  54.7  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  23.15 
 
 
547 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1772  nitroreductase  23.91 
 
 
536 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  22.99 
 
 
236 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  24.77 
 
 
551 aa  53.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  24.77 
 
 
538 aa  52.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  26.58 
 
 
253 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  23.65 
 
 
246 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  28.78 
 
 
229 aa  51.2  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  25.42 
 
 
564 aa  51.2  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  23.43 
 
 
251 aa  50.8  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  23.92 
 
 
237 aa  50.8  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  28.02 
 
 
248 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  27.74 
 
 
502 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  26.26 
 
 
249 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  24.08 
 
 
255 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  25.71 
 
 
207 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  31.58 
 
 
529 aa  48.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  21.39 
 
 
250 aa  48.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  22.47 
 
 
533 aa  47.8  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  31.65 
 
 
252 aa  47.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  23.04 
 
 
556 aa  47.8  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  27.34 
 
 
656 aa  47.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  24.88 
 
 
491 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  25.95 
 
 
257 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  36.11 
 
 
3002 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  24.44 
 
 
203 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  24.34 
 
 
257 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.05 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  29.63 
 
 
3739 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  24.32 
 
 
202 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  25.19 
 
 
221 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  26.9 
 
 
259 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  26.75 
 
 
363 aa  45.4  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  25.1 
 
 
356 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  25.59 
 
 
532 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  33.02 
 
 
471 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  26.49 
 
 
1514 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  24.06 
 
 
559 aa  44.3  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  26.11 
 
 
475 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  25.93 
 
 
251 aa  43.9  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  32.03 
 
 
251 aa  43.5  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>