166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0743 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  100 
 
 		 189 aa  391  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  84.66 
 
 		 205 aa  339  2e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  83.6 
 
 		 205 aa  338  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  47.12 
 
 		 239 aa  161  7e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  43.81 
 
 		 274 aa  160  9e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  43.23 
 
 		 235 aa  159  2e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  43.24 
 
 		 202 aa  157  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  39.67 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  42.16 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  41.15 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  39.18 
 
 		 234 aa  150  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  37.7 
 
 		 250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  41.71 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  35.48 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  33.69 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  39.2 
 
 		 257 aa  111  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  33.71 
 
 		 236 aa  108  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  35.48 
 
 		 255 aa  106  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  33.51 
 
 		 382 aa  101  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  33.89 
 
 		 257 aa  101  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  35.33 
 
 		 259 aa  99.8  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  30.21 
 
 		 251 aa  97.8  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  31.03 
 
 		 246 aa  97.8  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  31.79 
 
 		 253 aa  97.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  33.33 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  95.5  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  31.21 
 
 		 252 aa  94.4  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  32.8 
 
 		 217 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  34.57 
 
 		 247 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  32.8 
 
 		 262 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  32.8 
 
 		 217 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  32.8 
 
 		 217 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  32.8 
 
 		 217 aa  93.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  32.8 
 
 		 217 aa  93.6  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  32.8 
 
 		 305 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  32.6 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  31.68 
 
 		 244 aa  92  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  31.18 
 
 		 249 aa  91.7  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  32.58 
 
 		 252 aa  90.5  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  32.04 
 
 		 221 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  31.79 
 
 		 254 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  28.11 
 
 		 253 aa  89.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  32.31 
 
 		 375 aa  89.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  30.39 
 
 		 251 aa  89.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  34.68 
 
 		 256 aa  89.4  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  31.07 
 
 		 246 aa  89  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  32.79 
 
 		 249 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  29.14 
 
 		 248 aa  87  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  30.65 
 
 		 259 aa  87  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  32 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  35.62 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  28.8 
 
 		 252 aa  84.7  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  29.26 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  31.91 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  30 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  30.23 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  28.72 
 
 		 508 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  28.72 
 
 		 508 aa  81.3  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  27.32 
 
 		 357 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  31.91 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  31.91 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2541  hypothetical protein  28.18 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0273286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2726  hypothetical protein  28.18 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  31.38 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2553  hypothetical protein  27.62 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  hitchhiker  0.0000000044081 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  30.38 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  33.54 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  27.17 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  27.51 
 
 		 510 aa  75.5  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  31.21 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  27.22 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2736  hypothetical protein  27.62 
 
 		 325 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.78205e-21 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  31.09 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  29.03 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  27.27 
 
 		 218 aa  74.3  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  33.33 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  27.66 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  30.59 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  33.72 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  28.04 
 
 		 510 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  30.36 
 
 		 284 aa  72  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  26.98 
 
 		 509 aa  72  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  31.13 
 
 		 232 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  27.57 
 
 		 518 aa  68.2  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.57 
 
 		 530 aa  67.4  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  27.32 
 
 		 3021 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  28.26 
 
 		 523 aa  66.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  26.23 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  27.37 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  25.93 
 
 		 503 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  28.88 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  29.12 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.12 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  27.89 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  26.63 
 
 		 3002 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  28.19 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  25.93 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  30.2 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3674  AMP-dependent synthetase and ligase  26.06 
 
 		 860 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>