68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0248 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0248  nitroreductase  100 
 
 		 193 aa  399  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.167027  normal  0.791658 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  46.7 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  44.5 
 
 		 284 aa  152  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  44.85 
 
 		 282 aa  151  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  37.97 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  39.38 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  34.85 
 
 		 217 aa  120  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  37.63 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  37.5 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  36.5 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  36.5 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  36.5 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  36.5 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  36.5 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  36.5 
 
 		 262 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  36.56 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1109  hypothetical protein  35.68 
 
 		 249 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  36.5 
 
 		 305 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  35.68 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  38.5 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  39.79 
 
 		 219 aa  111  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  37.71 
 
 		 232 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  34.86 
 
 		 218 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4547  nitroreductase  36.51 
 
 		 217 aa  101  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00573594 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4414  hypothetical protein  36.51 
 
 		 217 aa  101  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.790049 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5587  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  34.92 
 
 		 223 aa  98.2  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.947853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  33.51 
 
 		 228 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  30.81 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  28.29 
 
 		 234 aa  85.5  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  28.5 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  26.79 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  28.86 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  25.37 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  28.87 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  27.17 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  26.67 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  26.13 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  25.5 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  27.32 
 
 		 225 aa  72  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  24.41 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  25.63 
 
 		 242 aa  64.7  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  28.25 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  25 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  29.55 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  27.87 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  27.75 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  25 
 
 		 249 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  27.42 
 
 		 253 aa  52.8  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  34.52 
 
 		 251 aa  50.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  27.21 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  24.1 
 
 		 382 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  24.73 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  25.43 
 
 		 254 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  26.38 
 
 		 255 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.05 
 
 		 244 aa  45.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  26.18 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  26.22 
 
 		 252 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  28.3 
 
 		 371 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  28.57 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  27.36 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  26.98 
 
 		 252 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  26.14 
 
 		 246 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  24.07 
 
 		 252 aa  42.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  25.29 
 
 		 251 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  37.33 
 
 		 245 aa  42  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  26.9 
 
 		 201 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  24.84 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  28.3 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>