103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1474 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  100 
 
 
251 aa  518  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  40.74 
 
 
253 aa  193  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  43.55 
 
 
259 aa  193  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  39.26 
 
 
251 aa  192  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  39.09 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  38.59 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  37.4 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  37.19 
 
 
248 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  39.09 
 
 
254 aa  162  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  36.28 
 
 
252 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  36.52 
 
 
257 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  37.23 
 
 
253 aa  159  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  35.78 
 
 
255 aa  151  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  34.33 
 
 
255 aa  149  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  37.66 
 
 
252 aa  148  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  36.74 
 
 
252 aa  145  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  36.06 
 
 
246 aa  145  5e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  34.31 
 
 
249 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  38.46 
 
 
203 aa  132  6.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  34.93 
 
 
256 aa  131  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  32.88 
 
 
236 aa  131  9e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  33.19 
 
 
257 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  34.13 
 
 
207 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  33.49 
 
 
382 aa  106  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  31.25 
 
 
250 aa  105  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.2 
 
 
244 aa  105  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  34.98 
 
 
221 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  36.69 
 
 
202 aa  99.4  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  32.35 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  33.5 
 
 
242 aa  97.8  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  30.52 
 
 
225 aa  96.3  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  31.49 
 
 
239 aa  92  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  30.73 
 
 
205 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  33.81 
 
 
234 aa  89.7  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  32.35 
 
 
274 aa  88.6  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  33.71 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.54 
 
 
207 aa  86.7  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  30 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  29.13 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.64 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  31.63 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  31.17 
 
 
510 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  32.42 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  30.56 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  29.34 
 
 
523 aa  73.2  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  30.3 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  27.72 
 
 
371 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  30.18 
 
 
503 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.7 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  30 
 
 
508 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  30 
 
 
508 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  32.64 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  29.21 
 
 
509 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  35.17 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  29.21 
 
 
510 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  28.97 
 
 
356 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  33.85 
 
 
518 aa  62.4  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  34.38 
 
 
354 aa  61.6  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  23.5 
 
 
530 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  25 
 
 
357 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  25.93 
 
 
529 aa  59.3  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.8 
 
 
391 aa  59.3  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  24.58 
 
 
556 aa  58.9  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  27.16 
 
 
564 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  30.91 
 
 
236 aa  56.2  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  26.71 
 
 
547 aa  55.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  26.09 
 
 
656 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  27.94 
 
 
559 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  28.97 
 
 
1514 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  29.31 
 
 
392 aa  52.4  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  23.11 
 
 
502 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2541  hypothetical protein  26.9 
 
 
329 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0273286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2726  hypothetical protein  26.9 
 
 
300 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2736  hypothetical protein  27.08 
 
 
325 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.78205e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2553  hypothetical protein  26.57 
 
 
325 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  hitchhiker  0.0000000044081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  31.43 
 
 
2454 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  27.21 
 
 
474 aa  48.9  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  28.68 
 
 
551 aa  48.5  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1009  amino acid adenylation domain-containing protein  30.25 
 
 
2706 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  28.68 
 
 
538 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  26.53 
 
 
558 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  25 
 
 
363 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  23.85 
 
 
475 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  28.37 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  25.19 
 
 
546 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  24.84 
 
 
532 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  26.98 
 
 
518 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  24.64 
 
 
514 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3945  hypothetical protein  24.82 
 
 
428 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0479721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  22.99 
 
 
492 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  32.03 
 
 
526 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.57 
 
 
461 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1376  hypothetical protein  27.27 
 
 
491 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  26.57 
 
 
513 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  26.57 
 
 
513 aa  42.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  24.68 
 
 
491 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1414  hypothetical protein  27.27 
 
 
513 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  26.57 
 
 
513 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  26.57 
 
 
513 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  26.57 
 
 
513 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>