136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3018 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  69.2 
 
 
255 aa  362  4e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  67.34 
 
 
254 aa  347  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  68.8 
 
 
252 aa  343  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  57.44 
 
 
253 aa  280  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  58.51 
 
 
252 aa  261  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  56.02 
 
 
256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  54.1 
 
 
255 aa  250  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  51.81 
 
 
249 aa  248  7e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  51.19 
 
 
257 aa  241  7.999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  48.68 
 
 
236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  47.3 
 
 
253 aa  214  7e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  41.39 
 
 
246 aa  204  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  43.57 
 
 
248 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  44.4 
 
 
257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  43.17 
 
 
251 aa  195  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  46.4 
 
 
251 aa  194  8.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  51.67 
 
 
203 aa  189  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  47.06 
 
 
259 aa  187  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  40.69 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  39.56 
 
 
252 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  36.28 
 
 
251 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  37.39 
 
 
382 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  37.37 
 
 
250 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  43.18 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  32.7 
 
 
221 aa  118  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  38.38 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  37.57 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  34.86 
 
 
244 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  32.42 
 
 
207 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  35.08 
 
 
274 aa  106  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  33.15 
 
 
202 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  32.39 
 
 
242 aa  105  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  34.55 
 
 
234 aa  104  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  32.75 
 
 
356 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  34.52 
 
 
235 aa  95.9  6e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.53 
 
 
391 aa  94.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  31.21 
 
 
189 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  32.62 
 
 
214 aa  93.6  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  25.75 
 
 
371 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  31.82 
 
 
237 aa  92.4  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  30.06 
 
 
205 aa  90.1  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  29.44 
 
 
205 aa  86.3  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  32.54 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  31.72 
 
 
259 aa  79  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  29.52 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  29.68 
 
 
375 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  27.19 
 
 
475 aa  72  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  29.72 
 
 
363 aa  72  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  31.51 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  24.14 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  25.82 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  26.17 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  30.3 
 
 
491 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  30.73 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  27.18 
 
 
508 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  27.75 
 
 
458 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  32.8 
 
 
236 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  27.18 
 
 
508 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  27.14 
 
 
509 aa  65.5  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  26.6 
 
 
510 aa  65.1  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  29.03 
 
 
218 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  31.85 
 
 
529 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1863  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like  34.46 
 
 
228 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  28.97 
 
 
510 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  33.33 
 
 
492 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  27.94 
 
 
656 aa  62  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  30.51 
 
 
471 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  27.67 
 
 
518 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  28.72 
 
 
284 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  23.58 
 
 
474 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5819  putative NADH oxidase (nitroreductase), NoxC-like protein  34.19 
 
 
232 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0914692 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  29.93 
 
 
354 aa  58.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5913  hypothetical protein  29.74 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0250235  normal  0.770563 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0217  nitroreductase  27.96 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0100894 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  29.28 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  25.53 
 
 
523 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0770  nitroreductase  27.06 
 
 
217 aa  56.2  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  30.46 
 
 
532 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  29.1 
 
 
217 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  29.1 
 
 
217 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  29.1 
 
 
217 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  29.1 
 
 
217 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  29.1 
 
 
217 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  27.22 
 
 
503 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  29.1 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2318  hypothetical protein  27.27 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.337641  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  25.23 
 
 
473 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  29.1 
 
 
305 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  27.61 
 
 
547 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6188  hypothetical protein  27.6 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.876994  normal  0.335719 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2709  nitroreductase  29.44 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.101258 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  30.77 
 
 
538 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  30.77 
 
 
551 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1228  hypothetical protein  27.72 
 
 
222 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  26.55 
 
 
222 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  25.76 
 
 
247 aa  52.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  31.96 
 
 
559 aa  52.4  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  28.18 
 
 
2454 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0382  hypothetical protein  27.22 
 
 
219 aa  52.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>