63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0637 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 461 aa  927    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  47.39 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  33.85 
 
 		 475 aa  219  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  35.52 
 
 		 473 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  36.02 
 
 		 491 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  32.41 
 
 		 474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  34.2 
 
 		 471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  37.09 
 
 		 492 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  33.33 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  37.86 
 
 		 235 aa  79  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  29.96 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  27.8 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  27.98 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  28.77 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  30.83 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  30.09 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  30.22 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  30.56 
 
 		 257 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  31.51 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  34.5 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  28.22 
 
 		 236 aa  68.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.78 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  30.69 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  27.68 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  33.63 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  32.86 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  32 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  31.65 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  26.87 
 
 		 251 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  27.5 
 
 		 257 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  31.69 
 
 		 214 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  33.17 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  27.62 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  31.29 
 
 		 266 aa  59.7  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  25.91 
 
 		 221 aa  59.3  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  32.82 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  28.43 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  28.07 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  31.58 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  31.33 
 
 		 252 aa  57  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  28.26 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  27.8 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  30.69 
 
 		 259 aa  53.9  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  32.89 
 
 		 236 aa  54.3  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  26.74 
 
 		 357 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  27.27 
 
 		 254 aa  53.5  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  33.6 
 
 		 252 aa  53.5  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  35.04 
 
 		 363 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  30.66 
 
 		 242 aa  50.8  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  27.92 
 
 		 202 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  31.97 
 
 		 256 aa  47.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4232  nitroreductase  30.77 
 
 		 250 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  31.86 
 
 		 508 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  31.86 
 
 		 508 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2589  hypothetical protein  31.77 
 
 		 537 aa  47  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0423242  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2434  hypothetical protein  26.92 
 
 		 538 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210466  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  30.77 
 
 		 510 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  26.53 
 
 		 242 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5597  hypothetical protein  29.51 
 
 		 222 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  32.69 
 
 		 514 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.26 
 
 		 244 aa  43.5  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  28.57 
 
 		 251 aa  43.5  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  27.42 
 
 		 207 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>