73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0878 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  100 
 
 
471 aa  970    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  44.23 
 
 
474 aa  360  4e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  43.74 
 
 
475 aa  324  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  37.5 
 
 
473 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  41.18 
 
 
458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  39.06 
 
 
491 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  38.61 
 
 
492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  34.2 
 
 
461 aa  167  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  29.15 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  24.88 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  25.07 
 
 
356 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  28.79 
 
 
375 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  24.6 
 
 
236 aa  72  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  24.08 
 
 
246 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  26.91 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  26.29 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  24.56 
 
 
251 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  27.13 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  22.45 
 
 
246 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  25.7 
 
 
257 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  27.1 
 
 
253 aa  65.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  28.72 
 
 
214 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  25.38 
 
 
392 aa  63.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  26.52 
 
 
253 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  24.55 
 
 
252 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  21.63 
 
 
252 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  25.12 
 
 
254 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  24.28 
 
 
255 aa  61.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  30.51 
 
 
252 aa  60.8  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  31.94 
 
 
508 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  31.94 
 
 
508 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  26.14 
 
 
221 aa  59.3  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  22.95 
 
 
248 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  27.12 
 
 
225 aa  57  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  23.47 
 
 
259 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  25.55 
 
 
256 aa  56.6  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  25.22 
 
 
249 aa  56.6  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  28.22 
 
 
242 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  29.61 
 
 
274 aa  54.7  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  25.84 
 
 
234 aa  54.3  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  25.32 
 
 
242 aa  53.5  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  23.33 
 
 
255 aa  53.5  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  30.2 
 
 
391 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  30.05 
 
 
235 aa  50.8  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1430  nitroreductase family protein  27.52 
 
 
262 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2324  hypothetical protein  27.52 
 
 
305 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.582283  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  26.25 
 
 
357 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  26.57 
 
 
509 aa  50.4  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  25.84 
 
 
239 aa  49.7  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  22.51 
 
 
523 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  25.88 
 
 
252 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  30.56 
 
 
3002 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  24.85 
 
 
510 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3092  hypothetical protein  26.8 
 
 
217 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3218  hypothetical protein  26.8 
 
 
217 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1344  hypothetical protein  26.8 
 
 
217 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826034  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1058  hypothetical protein  26.8 
 
 
217 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2034  hypothetical protein  26.8 
 
 
217 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0977  amino acid adenylation domain protein  26.85 
 
 
3739 aa  46.6  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4206  nitroreductase  30.51 
 
 
531 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  29.91 
 
 
510 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.97 
 
 
244 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  23.12 
 
 
207 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4034  hypothetical protein  30.26 
 
 
513 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  29.68 
 
 
564 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  31.52 
 
 
530 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0957  hypothetical protein  29.55 
 
 
514 aa  44.3  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1153  nitroreductase  23.29 
 
 
247 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2553  hypothetical protein  23.85 
 
 
325 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.319231  hitchhiker  0.0000000044081 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0354  hypothetical protein  33.02 
 
 
526 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  30.36 
 
 
363 aa  44.3  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  26.56 
 
 
341 aa  44.3  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  29.69 
 
 
236 aa  43.9  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>