168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0441 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  100 
 
 		 246 aa  508  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  57.92 
 
 		 253 aa  291  5e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  56.49 
 
 		 251 aa  271  7e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  53.75 
 
 		 248 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  49.17 
 
 		 252 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  52.08 
 
 		 259 aa  231  5e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  46.37 
 
 		 251 aa  228  7e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  44.4 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  47.72 
 
 		 252 aa  208  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  45.18 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  43.15 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  44.17 
 
 		 257 aa  205  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  46.12 
 
 		 256 aa  204  9e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  41.39 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  41.46 
 
 		 246 aa  203  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  45.92 
 
 		 257 aa  202  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  44.64 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  43.75 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  39.09 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  38.78 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  36.4 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  44.91 
 
 		 382 aa  165  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  42.42 
 
 		 203 aa  165  8e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  44.5 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  41.87 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  34.58 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  35.1 
 
 		 202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  35.55 
 
 		 225 aa  125  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  33.49 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  34.56 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  34.95 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  35.18 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  35.35 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  33.7 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  33.17 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  34.45 
 
 		 274 aa  108  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  35.35 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  34.27 
 
 		 237 aa  105  7e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  32.37 
 
 		 371 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  31.76 
 
 		 375 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4013  SagB-type dehydrogenase domain protein  31.75 
 
 		 207 aa  96.3  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  31.63 
 
 		 391 aa  95.9  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  31.28 
 
 		 205 aa  95.5  7e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  35.48 
 
 		 510 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  33.85 
 
 		 508 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  33.85 
 
 		 508 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  29.44 
 
 		 205 aa  92.8  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  32.98 
 
 		 510 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  28.46 
 
 		 475 aa  92.4  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  36.25 
 
 		 503 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  34.32 
 
 		 523 aa  92  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  29.2 
 
 		 357 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  32.98 
 
 		 509 aa  90.5  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1789  hypothetical protein  25.2 
 
 		 474 aa  89.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  31.07 
 
 		 189 aa  89  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0553  hypothetical protein  27.78 
 
 		 458 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  29.1 
 
 		 392 aa  82  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  29.35 
 
 		 356 aa  81.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  29.82 
 
 		 518 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0637  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.98 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  28.42 
 
 		 518 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  32.72 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  29.81 
 
 		 547 aa  75.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  28.57 
 
 		 473 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0930  nitroreductase  33.48 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6468  hypothetical protein  30.86 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.89 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  32.35 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  29.56 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  31.6 
 
 		 538 aa  73.2  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  31.6 
 
 		 551 aa  73.2  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0878  hypothetical protein  24.08 
 
 		 471 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.263268  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  28.65 
 
 		 2454 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24180  nitroreductase family protein  28.73 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  29.59 
 
 		 556 aa  69.3  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  28.51 
 
 		 529 aa  68.9  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4677  nitroreductase  29.21 
 
 		 492 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  26.61 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  26.92 
 
 		 3021 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  27.03 
 
 		 3002 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  31.33 
 
 		 431 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2426  hypothetical protein  27.64 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200361  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  25.75 
 
 		 656 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  28.07 
 
 		 602 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  29.17 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  28.48 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0979  amino acid adenylation domain protein  23.73 
 
 		 1514 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0920  hypothetical protein  27.47 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  29.94 
 
 		 564 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  33.86 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5837  hypothetical protein  25.42 
 
 		 502 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.532106  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1173  hypothetical protein  27.59 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1154  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  27.59 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1266  hypothetical protein  27.59 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1336  hypothetical protein  27.59 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17901e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1148  NADH oxidase (NADH dehydrogenase)  27.91 
 
 		 513 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0818  nitroreductase  28.19 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133971  hitchhiker  0.000000468643 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2273  nitroreductase  25.7 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  27.7 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0645  hypothetical protein  32 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>