75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3308 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3308  hypothetical protein  100 
 
 		 602 aa  1223    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0405208 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2350  hypothetical protein  32.5 
 
 		 533 aa  281  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00119506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4422  hypothetical protein  34.27 
 
 		 532 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3720  hypothetical protein  41.19 
 
 		 540 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12860  hypothetical protein  40.91 
 
 		 531 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.742525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1165  hypothetical protein  40.61 
 
 		 531 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.492264  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2349  hypothetical protein  39.93 
 
 		 564 aa  193  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  39.6 
 
 		 656 aa  192  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0146  hypothetical protein  47.69 
 
 		 556 aa  190  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0222  hypothetical protein  42.17 
 
 		 529 aa  187  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2171  hypothetical protein  42.06 
 
 		 547 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3274  hypothetical protein  36.57 
 
 		 546 aa  166  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1221  hypothetical protein  41.12 
 
 		 551 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000102036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1503  nitroreductase, putative  41.12 
 
 		 538 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.805346  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1772  nitroreductase  35.66 
 
 		 536 aa  156  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1422  hypothetical protein  35.71 
 
 		 558 aa  146  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48680  mcbC-like_oxidoreductase  39.19 
 
 		 559 aa  141  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  22.88 
 
 		 510 aa  92  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3630  SagB-type dehydrogenase domain protein  22.24 
 
 		 530 aa  76.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  24.28 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  26.09 
 
 		 503 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  33.59 
 
 		 214 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2100  hypothetical protein  27.36 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000120456 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  26.58 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  25.21 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  25.21 
 
 		 508 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  26.47 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  30.51 
 
 		 259 aa  66.6  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3945  hypothetical protein  26.11 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0479721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  24.28 
 
 		 523 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  25.84 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  27.32 
 
 		 274 aa  62  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  25.28 
 
 		 236 aa  62  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  30.39 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  24.88 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  26.2 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  28.07 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  25.45 
 
 		 248 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  28.26 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0348  nitroreductase  29.86 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  28.17 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0193  hypothetical protein  34.88 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  28.96 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  27.22 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  31.2 
 
 		 225 aa  57  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  27.41 
 
 		 259 aa  57  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0302  hypothetical protein  65.79 
 
 		 47 aa  56.6  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0581  SagB-type dehydrogenase domain protein  27.06 
 
 		 391 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00313283  unclonable  0.00000422679 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  28.65 
 
 		 253 aa  55.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  27.22 
 
 		 254 aa  54.7  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  29.1 
 
 		 246 aa  54.7  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.66 
 
 		 244 aa  53.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  29.1 
 
 		 252 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0919  hypothetical protein  29.77 
 
 		 610 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  26.58 
 
 		 202 aa  52.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  26.37 
 
 		 237 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  31.16 
 
 		 252 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  23.08 
 
 		 518 aa  52.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  28.24 
 
 		 356 aa  51.6  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  31.58 
 
 		 255 aa  51.6  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  27.1 
 
 		 249 aa  51.2  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  29.85 
 
 		 252 aa  50.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  26.9 
 
 		 242 aa  49.7  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  27.11 
 
 		 255 aa  48.9  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3691  hypothetical protein  25.27 
 
 		 551 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  27.7 
 
 		 242 aa  48.9  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  23.5 
 
 		 235 aa  48.5  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0807  SagB-type dehydrogenase domain protein  25.33 
 
 		 229 aa  47  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  22.35 
 
 		 221 aa  46.2  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  25.15 
 
 		 251 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  28.68 
 
 		 256 aa  45.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0920  hypothetical protein  29.47 
 
 		 240 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0933  hypothetical protein  25.85 
 
 		 203 aa  44.7  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1729  hypothetical protein  41.46 
 
 		 44 aa  44.3  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>